典型文献
肝癌基于m6A甲基化调节基因对肝癌分型及预后建模
文献摘要:
目的:基于m6A甲基化调节基因对肝癌进行聚类分型并构建模型评估预后风险。方法:基于13个m6A甲基化调节基因在肝癌中的表达情况,使用一致性聚类分析对来自TCGA数据库的肝癌患者进行分型,并对所得亚型的功能和预后意义进行研究。进一步筛选标记基因构建风险预测模型,用于评估肝癌患者的预后。结果:基于m6A甲基化调节基因进行分型所得到的2个亚组在肝癌患者预后方面差异具有统计学意义(
P=0.048),并在预后较差的亚组中筛选得到了38个在肝癌中与m6A甲基化相关的预后标志物;利用单因素cox分析鉴定出2个与肝癌不良预后有关的m6A调节基因:YTHDF1和YTHDF2(风险比>1,
P<0.05);通过Lasso回归构建了风险预测模型能够有效预测肝癌患者4年内的预后状态(4年和3年的曲线下面积分别为0.685、0.669),并使用来自亚洲肝癌患者的数据集对该模型进行了验证。
结论:此研究为基于m6A甲基化的肝癌诊断和治疗提供新思路,且风险预测模型可以用于评估肝癌患者的短期预后情况。
文献关键词:
肝癌;甲基化;评估模型;N6-甲基腺苷;聚类分析
中图分类号:
作者姓名:
刘芳远;冯学敏;季晓磊;苏秀兰
作者机构:
内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心,呼和浩特 010010;内蒙古大学生命科学院,呼和浩特 010010;内蒙古医学细胞生物学重点实验室,呼和浩特 010010;内蒙古医科大学附属医院感染科,呼和浩特 010010
文献出处:
引用格式:
[1]刘芳远;冯学敏;季晓磊;苏秀兰-.肝癌基于m6A甲基化调节基因对肝癌分型及预后建模)[J].中华肝脏病杂志,2022(09):962-969
A类:
B类:
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AB值:
0.338779
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