典型文献
通过生物信息学方法筛选新的肝细胞癌复发关键蛋白
文献摘要:
目的 寻找肝癌复发新的标志物.方法 本研究的蛋白质组学数据来自临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium,CPTAC)数据库.将下载的数据根据肝癌是否复发进行分组,分析两组之间的差异蛋白.生存分析、Cox回归和ROC曲线被用来筛选更具临床意义的差异蛋白.在人类蛋白图谱数据库中对关键的蛋白进行了验证.结果 在50例复发和77例未复发的乙型肝炎相关肝癌患者中,获得了 690个差异表达蛋白.其中,39个蛋白与肝癌的生存分析相关,18个蛋白是肝癌预后的独立影响因素,7种蛋白(BAHCC1、ESF1、RAP1GAP、RUFY1、SCAMP3、STK3和TMEM230)对肝癌5年生存预测的ROC曲线下面积>0.7.结论 本研究发现了预测肝癌复发的新蛋白,这些关键蛋白是肝癌预后的独立影响因子.
文献关键词:
肝癌;蛋白质组学;临床蛋白质组学肿瘤分析联盟
中图分类号:
作者姓名:
杨永勤;冯巩;郝帅;陈敏;梁甜;闫红林;贺娜
作者机构:
西安医学院第一附属医院,陕西 710077;西安医学院
文献出处:
引用格式:
[1]杨永勤;冯巩;郝帅;陈敏;梁甜;闫红林;贺娜-.通过生物信息学方法筛选新的肝细胞癌复发关键蛋白)[J].肝脏,2022(11):1170-1174
A类:
临床蛋白质组学肿瘤分析联盟,BAHCC1,ESF1,RAP1GAP,RUFY1,SCAMP3,STK3,TMEM230
B类:
生物信息学方法,肝细胞癌,关键蛋白,肝癌复发,组学数据,Clinical,Proteomic,Tumor,Analysis,Consortium,CPTAC,下载,差异蛋白,生存分析,Cox,谱数据,乙型肝炎相关肝癌,肝癌患者,差异表达蛋白,独立影响因素,种蛋,生存预测
AB值:
0.252551
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