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构建"免疫相关lncRNA基因对"模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后及药物敏感性
文献摘要：
目的 构建"免疫相关lncRNA基因对"模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后并分析不同组别肿瘤免疫微环境特征及药物敏感性.方法 从XENA数据库获取肝细胞肝癌样本正常肝脏样本的RNA-seq数据,筛选出未发生远处转移的原位肝癌样本,提取免疫相关lncRNA,构建免疫相关lncRNA基因对的预测模型;随后将免疫相关lncRNA基因对预测模型与患者的预后及临床因素进行相关性分析;同时利用肿瘤免疫细胞浸润数据计算高低风险组免疫微环境特征差异,并评估肝癌相关药物在不同风险组的敏感性.结果 筛选出免疫相关lncRNA基因对13个,并结合生存状况建立预测模型,低风险组患者的生存获益显著优于高风险组(P<0.001).在肿瘤免疫微环境方面,高风险组表现出了更为突出的免疫抑制状态,药物敏感性分析表明索拉非尼、阿昔替尼在基于风险分组的患者中敏感性显著不同.结论 免疫相关lncRNA的基因对模型能够较好的预测未发生远处转移的原位肝癌患者预后情况,高风险的患者中免疫抑制状态明显,而不同的风险组对肝癌特定药物治疗敏感性不同.
文献关键词：
肝细胞肝癌;肿瘤预后;癌症基因组图谱数据库(TCGA);基因型和基因表达量关联数据库(GTEx);免疫微环境;长链非编码RNA
中图分类号：
作者姓名：
李睿哲;薛军帅;杨龙山;董兆如;洪建国;李涛;王东旭
作者机构：
山东大学齐鲁医院 肝胆外科,山东 济南 250012
文献出处：
引用格式：
[1]李睿哲;薛军帅;杨龙山;董兆如;洪建国;李涛;王东旭-.构建"免疫相关lncRNA基因对"模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后及药物敏感性)[J].肝胆胰外科杂志,2022(07):406-413
A类：
B类：
免疫相关,lncRNA,远处转移,组别,肿瘤免疫微环境,环境特征,XENA,肝细胞肝癌,本正,seq,临床因素,肿瘤免疫细胞浸润,数据计算,算高,低风险组,特征差异,生存状况,高风险组,环境方面,免疫抑制,药物敏感性分析,索拉非尼,阿昔替尼,基于风险,肝癌患者,预后情况,治疗敏感性,肿瘤预后,癌症基因组图谱数据库,TCGA,基因型,基因表达量,关联数据,GTEx,长链非编码
AB值：
0.278762
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