典型文献
紫菜腐霉激发子基因家族特征及其在感染过程中的作用
文献摘要：
[背景]激发子(elicitin)是卵菌(Oomycetes)疫霉和腐霉分泌的可诱发宿主产生免疫反应的小分子化合物.[目的]鉴定紫菜腐霉激发子基因家族,分析其结构特征和在感染宿主过程中可能的作用机制.[方法]运用同源比对法筛查紫菜腐霉NBRC33253基因组中激发子基因家族成员,利用生物信息学工具分析激发子家族的理化性质和系统进化,并结合转录组数据和GO功能注释,探讨其在感染宿主过程中可能的作用机制.[结果]紫菜腐霉基因组中发现22个激发子基因家族成员,其中,17个为胞外分泌蛋白,4个定位于质膜,1个锚定于高尔基体.紫菜腐霉激发子基因结构简单保守,含有1-2个CDS序列,每个成员基因编码的氨基酸数目介于114-2100 aa之间,等电点PI在3.61-9.88之间;系统进化分析显示,紫菜腐霉激发子家族成员存在扩张;表达模式分析说明,紫菜腐霉激发子在感染宿主后6个激发子基因表达量上调,7个激发子基因表达量下调,推测可能具有多个生物学功能,如GO功能注释到纤维素结合激发子凝集素(cellulose binding elicitor lectin,CBEL)和共生体对宿主防御相关程序性细胞死亡的调节过程.[结论]紫菜腐霉激发子基因家族结构保守,均属于ELL (elicitin-like)亚类,可能具有纤维素结合激发子凝集素(CBEL)和加速宿主细胞程序性死亡的功能,结合纤维素,附着在宿主表面,发挥蛋白激酶活性,触发宿主MAPK信号传导通路介导的免疫反应,促进HR细胞死亡.本研究为进一步解析紫菜腐霉的致病机制及紫菜抗病性状的遗传育种提供了理论基础.
文献关键词：
紫菜腐霉;激发子;赤腐病;感染机制
中图分类号：
作者姓名：
刘聪;杜国英;唐磊;高天;唐祥海;莫照兰;茅云翔
作者机构：
中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室,山东青岛266003;海南热带海洋学院水产与生命学院热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室,海南三亚572022
文献出处：
引用格式：
[1]刘聪;杜国英;唐磊;高天;唐祥海;莫照兰;茅云翔-.紫菜腐霉激发子基因家族特征及其在感染过程中的作用)[J].微生物学通报,2022(01):139-152
A类：
紫菜腐霉,elicitin,Oomycetes,NBRC33253,elicitor,CBEL,ELL
B类：
激发子,基因家族,主产,免疫反应,小分子化合物,同源比对,比对法,利用生物,生物信息学工具,转录组数据,功能注释,胞外分泌,分泌蛋白,质膜,锚定,定于,高尔基体,基因结构,结构简单,CDS,基因编码,aa,等电点,系统进化分析,表达模式分析,基因表达量,生物学功能,凝集素,cellulose,binding,lectin,共生体,宿主防御,程序性细胞死亡,like,亚类,主细胞,细胞程序性死亡,合纤,主表,蛋白激酶,激酶活性,MAPK,信号传导通路,致病机制,抗病性状,遗传育种,赤腐病,感染机制
AB值：
0.250888
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