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全基因组测序在病原菌分型与溯源中的应用研究进展
文献摘要：
细菌分子分型已成为监测细菌感染性疾病的暴发流行与明确病原菌传播途径的重要工具.随着全基因组测序技术的日益兴起,公共数据库中已产生大量的细菌基因组数据,迫切需要研究人员充分认识和理解该技术,并掌握多种生物信息学工具挖掘并解读测序数据.本文系统概述了全基因组测序技术与生物信息学工具在病原菌分型与溯源中的应用,并对全基因组测序技术在临床诊疗实践中存在的挑战以及未来应用前景进行了探讨.
文献关键词：
全基因组测序;生物信息学;基因组流行病学;分型与溯源;暴发流行
中图分类号：
作者姓名：
贾慧琼;阮陟
作者机构：
浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江杭州310003;浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,浙江杭州310003;浙江大学医学院附属邵逸夫医院生物医学研究中心,浙江杭州310016;浙江省微生物技术与生物信息研究重点实验室,浙江杭州310016
文献出处：
引用格式：
[1]贾慧琼;阮陟-.全基因组测序在病原菌分型与溯源中的应用研究进展)[J].微生物学报,2022(03):949-967
A类：
分型与溯源
B类：
全基因组测序,分子分型,细菌感染性疾病,暴发流行,传播途径,公共数据库,细菌基因组,基因组数据,生物信息学工具,序数,临床诊疗,诊疗实践,未来应用,基因组流行病学
AB值：
0.201661
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