典型文献
基于高通量测序的福建北部马铃薯晚疫病株根际土壤细菌群落分析
文献摘要：
[背景]马铃薯晚疫病是一种由致病疫霉[Phytophthora infestans(Mont.)de Bary]引起的毁灭性病害,当环境条件适宜时,残留在土壤中的病原菌会侵染马铃薯植株导致病害的发生.[目的]明确健康马铃薯植株与发病植株的根际土壤细菌结构与多样性.[方法]采集马铃薯晚疫病发病地的健康植株根际土壤(M2J)和发病植株根际土壤(M2G),对土样中的细菌群落进行基于Illumina MiSeq测序平台的宏基因组高通量测序分析.[结果]发病植株根际土壤细菌的优质序列比健康植株少3.31％(1 747条),OTU少24.58％(1 466个).在门水平上,健康植株和发病植株根际土壤微生物组成相似,但相对丰度存在显著差异.其中发病后植株根际土壤菌群变形菌门(Proteobacteria)相对丰度增加17.70％,绿弯菌门(Chiloroflexi)相对丰度增加了 1.58％,而酸杆菌门(Acidobacteria)相对丰度降低了 6.13％,放线菌门(Actinobacteria)相对丰度降低了 4.28％,芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)相对丰度降低了 1.41％,疣微菌门(Verrucomicrobia)相对丰度降低了 3.11％.在属水平上,发病植株根际的Rhodanobacter和鞘氨醇单孢菌属(Sphingomonas)相对丰度比健康植株增加了 8.63％和3.51％;而 Vicinamibacteraceae、norank_f_norank_o_Vicinamibacterales、norank_f_Gemmatimonadaceae、Chujaibacter 和黄杆菌属(Flavobacterium)的相对丰度低于健康马铃薯植株.[结论]感染马铃薯晚疫病后的植株根际土壤细菌结构和多样性显著低于健康植株,细菌菌落多样性降低,且部分优势细菌门、属类群占比发生改变.
文献关键词：
马铃薯;晚疫病;根际微生物;多样性
中图分类号：
作者姓名：
李华伟;罗文彬;许国春;刘中华;林志坚;许泳清;纪荣昌;邱思鑫;汤浩
作者机构：
福建省农业科学院作物研究所福建省特色旱作物品种选育工程技术研究中心农业农村部南方薯类科学观测实验站,福建福州350013
文献出处：
引用格式：
[1]李华伟;罗文彬;许国春;刘中华;林志坚;许泳清;纪荣昌;邱思鑫;汤浩-.基于高通量测序的福建北部马铃薯晚疫病株根际土壤细菌群落分析)[J].微生物学通报,2022(03):1017-1029
A类：
M2J,M2G,Chiloroflexi,Vicinamibacteraceae
B类：
马铃薯晚疫病,病株,根际土壤细菌,土壤细菌群落,群落分析,致病疫霉,Phytophthora,infestans,Mont,Bary,毁灭性,侵染,植株,康马,细菌结构,落进,Illumina,MiSeq,测序平台,宏基因组高通量测序,高通量测序分析,OTU,根际土壤微生物,土壤微生物组,微生物组成,相对丰度,土壤菌群,变形菌门,Proteobacteria,酸杆菌,Acidobacteria,放线菌,Actinobacteria,单胞菌,Gemmatimonadetes,Verrucomicrobia,Rhodanobacter,鞘氨醇,Sphingomonas,丰度比,norank,Vicinamibacterales,Gemmatimonadaceae,Chujaibacter,黄杆菌属,Flavobacterium,细菌菌落,菌落多样性,类群,根际微生物
AB值：
0.320789
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