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基于分子模拟的河鲀毒素核酸适配体的连续优化
文献摘要：
河鲀毒素(tetrodotoxin,TTX)是一种生物碱类神经毒素,其中毒事件在世界范围内广泛发生,严重危害到人类健康,但尚无特效解毒剂,因此TTX的检测对食品安全领域有重大意义.为了得到更高效的TTX识别元件,在分子模拟指导下对SELEX筛选所得的核酸适配体TTX-27进行了连续优化.首先,使用Mini-hairpin结构替换阻碍TTX结合的茎环结构,使TTX更易与截短型适配体结合,然后将T39、C40碱基突变为C39、T40碱基,并对C39进行了 2'-OH修饰,以增强结合区域碱基与TTX的氢键作用和范德瓦耳斯相互作用.微量热泳动(microscale thermophoresis,MST)实验证实,经截短、碱基突变和化学修饰的各适配体变体的亲和力均有提高,其中化学修饰变体TTX-D2-X-R结合TTX的解离平衡常数Kd 为1.08 nmol/L,相较于TTX-27的亲和力提高了 75.5倍.表明基于分子模拟的截短-突变-化学修饰是核酸适配体post-SELEX优化的有效途径,所得的适配体变体TTX-D2-X-R在TTX检测领域有着潜在的应用价值.
文献关键词：
河鲀毒素;核酸适配体;分子模拟;碱基截短;碱基突变;化学修饰
中图分类号：
作者姓名：
颜志超;宋梦华;刘建平;黄强
作者机构：
复旦大学生命科学学院 上海 200438
文献出处：
引用格式：
[1]颜志超;宋梦华;刘建平;黄强-.基于分子模拟的河鲀毒素核酸适配体的连续优化)[J].中国生物工程杂志,2022(08):1-12
A类：
tetrodotoxin,T39,碱基截短
B类：
分子模拟,河鲀毒素,核酸适配体,TTX,生物碱类,神经毒素,中毒事件,严重危害,特效,解毒剂,食品安全,安全领域,了得,识别元件,SELEX,Mini,hairpin,茎环结构,C40,碱基突变,C39,T40,氢键作用,范德瓦,微量热,热泳,microscale,thermophoresis,MST,化学修饰,变体,亲和力,D2,解离,平衡常数,Kd,nmol,post,检测领域
AB值：
0.313014
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