典型文献
谷子光敏色素基因光周期、非生物胁迫响应特性及关键自然变异位点鉴定
文献摘要：
比较分析光敏色素基因家族成员对光周期、非生物胁迫响应模式并鉴定其有利自然变异类型,为全面了解光敏色素基因家族在光周期调控谷子生长发育及应对非生物胁迫中的作用机制、开展关键性状的分子辅助选择奠定基础.文中利用RT-PCR技术从超晚熟谷子农家种'毛粟,中克隆了3个光敏色素基因SiPHYA、SiPHYB和SiPHYC;在进行生物信息学分析后,利用荧光定量PCR技术研究了3个基因的光周期调控模式及对聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)模拟干旱、自然干旱、脱落酸(abscisic acid,ABA)、高温、NaCl五种非生物胁迫的响应特性;最后检测这3个基因在160份谷子材料的突变位点,通过单倍型分析确定基因的功能效应.结果表明,获得了基因SiPHYA、SiPHYB和SiPHYC包含完整编码区的cDNA序列,长度分别为3 981、3 953、3 764 bp,其中基因SiPHYB和SiPHYC具有较近的进化关系.基因SiPHYA、SiPHYB和SiPHYC均受光周期调控,但光周期对SiPHYB、SiPHYC昼夜表达模式的影响要强于SiPHYA;短日照条件临近抽穗SiPHYA、SiPHYB表达水平显著低于长日照,暗示其在谷子长日照抑制抽穗中发挥作用.SiPHYB和SiPHYC共同响应PEG模拟干旱、自然干旱、ABA、高温4种胁迫;SiPHYA和SiPHYB以不同方式响应盐胁迫,SiPHYC没有参与谷子盐胁迫响应过程.基于160份谷子材料重测序数据发现基因SiPHYB高度保守,基因SiPHYA含有两个错义突变:单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)7 034 522C→T,SNP7 036 657G→C,导致延迟抽穗、增加株高.基因SiPHYC含有一个错义突变(SNP5 414 823G→T),导致短日照缩短抽穗期,长日照延长抽穗期,对株高、穗长的增加作用不受光温环境影响.光周期对基因SiPHYA、SiPHYB和SiPHYC具有不同的调控作用,除了盐胁迫,SiPHYB和SiPHYC共同响应多种非生物胁迫,相比参考基因型,SiPHYA、SiPHYC突变延迟抽穗、增加株高和穗长.
文献关键词：
谷子;光敏色素基因;非生物胁迫;表达分析;单倍型
中图分类号：
作者姓名：
贾小平;张博;何占祥;李剑峰;张小梅;葛迪;王振山;桑璐曼;宋志伟
作者机构：
河南科技大学农学院,河南洛阳471023
文献出处：
引用格式：
[1]贾小平;张博;何占祥;李剑峰;张小梅;葛迪;王振山;桑璐曼;宋志伟-.谷子光敏色素基因光周期、非生物胁迫响应特性及关键自然变异位点鉴定)[J].生物工程学报,2022(05):1929-1945
A类：
SiPHYA,SiPHYB,SiPHYC,522C,657G,823G
B类：
谷子,光敏色素基因,非生物胁迫,胁迫响应,响应特性,自然变异,变异位点,基因家族,响应模式,变异类型,光周期调控,助选,晚熟,农家种,生物信息学分析,调控模式,聚乙二醇,polyethylene,glycol,PEG,自然干旱,脱落酸,abscisic,acid,ABA,NaCl,突变位点,单倍型分析,功能效应,整编,编码区,cDNA,bp,进化关系,昼夜,表达模式,短日照,暗示,子长,不同方式,盐胁迫,响应过程,重测序,序数,错义突变,单核苷酸多态性,single,nucleotide,polymorphism,SNP7,株高,SNP5,抽穗期,穗长,参考基因,基因型,表达分析
AB值：
0.218792
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