典型文献
原代人口腔角质细胞在产黑普氏菌作用后的转录组分析
文献摘要：
目的 探究产黑普氏菌(Prevotella melaninogenica,P.m)作用下原代人口腔角质细胞(primary human oral keratinocytes,pHOK)的转录组变化,并在人口腔角质形成细胞(human oral keratinocyte,HOK)细胞系中进行验证.方法 分离培养pHOK,并与P.m共培养4 h与24 h,提取总RNA,构建基因文库,转录组测序,分析差异表达基因,并进行基因本体论(gene ontology,GO)通路分析与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclo?pedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析,在HOK与P.m共培养模型中采用qRT?PCR及Western Blot对差异基因进行验证.结果 在pHOK与P.m共培养4 h组与对照组间上调表达的差异基因有:淋巴细胞胞浆蛋白1(lymphocyte cytosolic protein 1,LCP1)、角蛋白7(keratin 7,KRT7)、纤毛和鞭毛相关蛋白251(cilia and flagel?la associated protein 251,CFAP251)等,下调表达的差异基因有:含FERM、RhoGEF和Pleckstrin结构域蛋白1(FERM,ARH/RhoGEF and Pleckstrin domain protein 1,FARP1)、WW结构域转录调控因子1(WW domain contain?ing transcription regulator 1,WWTR1)、含Discoidin、CUB和LCCL结构域蛋白2(Discoidin,CUB and LCCL domain?containing protein 2,DCBLD2)等,共1788个差异表达基因;24 h组与对照组间上调表达的差异基因有:LCP1、补体C1s(complement C1s,C1S)、犬尿氨酸酶(kynureninase,KYNU)等,下调表达的差异基因有:磷酸丝氨酸转氨酶?1(phosphoserine aminotransferase 1,PSAT1)、FARP1、FKBP型脯氨酰异构酶10(FKBP prolyl isomerase 10,FKBP10)等,共1832个差异表达基因;其中共同差异表达基因(common differentially expressed genes,cDEGs)有LCP1、KYNU、长链非编码RNA958(long intergenic non?protein coding RNA 958,LINC00958)等1090个,差异均具有统计学意义.通过GO数据库分析,cDEGs主要富集到细菌对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、细胞的顶端部分等;通过KEGG分析,cDEGs富集到的通路有白介素?17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体通路等;从cDEGs中筛选肌球蛋白1B(myosin1B,MYO1B)在HOK与P.m共培养模型中进行验证,qRT?PCR及Western Blot检测结果表明,MYO1B的表达在对照组和P.m刺激组之间存在显著性差异(P<0.001),且其表达随P.m刺激时间的延长及刺激浓度的增大而递增.结论 P.m对口腔角质细胞的转录组存在重要影响.
文献关键词：
口腔扁平苔藓;产黑普氏菌;转录组测序;肌球蛋白1B;上皮屏障功能;白介素-17信号通路;肿瘤坏死因子信号通路;Toll样受体通路;细胞顶端部分
中图分类号：
作者姓名：
郭艺婷;韩文豪;徐盼;邵如如;何园
作者机构：
同济大学口腔医学院,上海 200072;上海第十人民医院消化内科同济大学生命科学与技术学院,上海 200092
文献出处：
引用格式：
[1]郭艺婷;韩文豪;徐盼;邵如如;何园-.原代人口腔角质细胞在产黑普氏菌作用后的转录组分析)[J].口腔疾病防治,2022(09):620-629
A类：
产黑普氏菌,melaninogenica,pHOK,flagel,CFAP251,RhoGEF,FARP1,Discoidin,DCBLD2,kynureninase,KYNU,phosphoserine,FKBP10,cDEGs,RNA958,myosin1B,MYO1B,细胞顶端部分
B类：
原代,角质细胞,转录组分析,Prevotella,primary,human,oral,keratinocytes,角质形成细胞,细胞系,分离培养,共培养,基因文库,转录组测序,差异表达基因,基因本体论,ontology,通路分析,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclo,pedia,Genes,Genomes,培养模型,qRT,Blot,差异基因,lymphocyte,cytosolic,protein,LCP1,角蛋白,KRT7,纤毛,鞭毛,cilia,associated,FERM,Pleckstrin,结构域,ARH,domain,转录调控因子,transcription,regulator,WWTR1,CUB,LCCL,containing,补体,C1s,complement,C1S,犬尿氨酸,丝氨酸,转氨酶,aminotransferase,PSAT1,脯氨,异构酶,prolyl,isomerase,common,differentially,expressed,genes,长链非编码,long,intergenic,coding,LINC00958,数据库分析,脂多糖,白介素,肿瘤坏死因子信号通路,Toll,样受体,肌球蛋白,对口,口腔扁平苔藓,上皮屏障功能
AB值：
0.304083
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