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口腔扁平苔藓组织环状RNA表达谱的筛选与初步探讨
文献摘要：
目的:构建人口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)组织的环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,筛选并验证口腔扁平苔藓组织中异常表达的circRNA,为疾病的诊断和治疗提供理论基础.方法:选择2018年9月—12月就诊于上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔黏膜病科的口腔扁平苔藓初诊患者6例,同期健康志愿者6例,利用高通量测序技术对口腔扁平苔藓和正常口腔黏膜组织中RNA进行测序和鉴定分析,分析组间circRNA的表达差异,然后利用qRT-PCR对分析结果进行验证.采用SPSS 24.0软件包对数据进行统计学分析,最后应用生物信息学技术GO(Gene Ontology)富集分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析差异基因的功能及相关通路.结果:测序结果显示,与健康口腔黏膜组织相比,在口腔扁平苔藓组织中共检测出85种差异表达2倍以上的circRNA,其中66种高表达,19种低表达.分别取上调、下调最显著的3个circRNA,在更多样本中进行qRT-PCR验证,其结果与测序结果一致.结论:口腔扁平苔藓组织与正常口腔黏膜组织之间存在差异表达的circRNAs,这些circRNAs可能参与口腔扁平苔藓的致病调控,是潜在的疾病新型诊断和治疗的生物学标志物.
文献关键词：
口腔扁平苔藓;环状RNA;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
王灏钰;沈雪敏;沈征宇
作者机构：
上海交通大学医学院附属第九人民医院 皮肤科,上海 200011;上海交通大学医学院附属第九人民医院 口腔黏膜病科,上海 200011
文献出处：
引用格式：
[1]王灏钰;沈雪敏;沈征宇-.口腔扁平苔藓组织环状RNA表达谱的筛选与初步探讨)[J].上海口腔医学,2022(05):535-539
A类：
B类：
口腔扁平苔藓,表达谱,oral,lichen,planus,OLP,circular,异常表达,诊断和治疗,上海交通大学,学医,第九人,口腔黏膜病,初诊患者,健康志愿者,高通量测序技术,对口,鉴定分析,表达差异,qRT,软件包,统计学分析,生物信息学技术,Ontology,富集分析,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,通路分析,差异基因,相关通路,种差,差异表达,低表达,circRNAs,生物学标志物
AB值：
0.263171
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