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典型文献
新疆部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况调查及基因多态性分析
文献摘要:
目的 了解新疆维吾尔自治区(简称新疆)部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况和基因多态性,为该地区细粒棘球蚴病的防治提供数据参考.方法 于2020-2021年从伊宁市、阿勒泰市、塔城市、昭苏县、特克斯县、额敏县、博乐市的定点屠宰场采集屠宰后牛、羊的肝脏和肺脏,通过肉眼观察与触摸初步判定感染情况,采集疑似细粒棘球蚴包囊并提取DNA,PCR扩增细粒棘球绦虫细胞色素氧化酶1(cox1)基因并测序.从GenBank中下载细粒棘球绦虫cox1基因G1、G3、G4、G5、G6型序列,与测定的序列行BLAST比对.利用MEGA 7.0软件用邻接法构建系统进化树,用Popart软件构建cox1基因单倍型网络图,用DnaSPv5软件分析cox1基因多态性位点.使用SPSS17.0软件进行统计学分析,对不同地区牛、羊及不同脏器感染率的比较采用x2检验.结果 新疆7个县(市)共调查4 977头(只)牛、羊(牛563头、羊4 414只),采集到疑似细粒棘球蚴包囊141份,其中121份扩增出850 bp的条带并测序成功.牛、羊总感染率为2.07%(103/4 977),其中博乐市牛、羊的感染率最高(6.50%,32/492),与伊宁市(1.80%,38/2 108)、塔城市(1.14%,9/790)、特克斯县(1.06%,2/189)、额敏县(0.72%,7/970)相比,感染率差异有统计学意义(x2=49.873、33.682、8.762、28.666,均P<0.05).牛、羊的感染率分别为3.02%(17/563)、1.95%(86/4 414),两者差异有统计学意义 a2=14.296,P<0.05).共采集羊肝、肺包囊101份,其中肝包囊占42.57%(43/101),肺包囊占27.72%(28/101),肝、肺合并感染包囊占29.70%(30/101).共采集牛肝、肺包囊20份,其中肝包囊占25.00%(5/20),肺包囊占45.00%(9/20),肝、肺合并感染包囊占30.00%(6/20).BLAST比对结果显示,121条序列中120条(99.2%)与细粒棘球绦虫G1基因型序列-(MN886258.1、MG280957.1、KX020359.1和MG672143.1)的同源性为98%~100%,在系统进化树上聚为一支;1条(0.8%)与G3基因型序列(MG682532.1)的同源性为100%,在系统进化树上聚为一支.单倍型分析结果显示,cox1基因序列共有18个单倍型,Hap 1~Hap 17为G1型,Hap 18为G3型,其中Hap 1为最大的单倍型群体;18个单倍型间共有20个变异位点.序列比对结果显示,121条序列中有52条出现了碱基的转换和颠换.结论 新疆7个县(市)牛、羊细粒棘球蚴感染率存在明显差异,感染细粒棘球蚴的基因型为G1(99.2%)、G3(0.8%),有18个单倍型,Hap 1为主要致病单倍型.
文献关键词:
细粒棘球蚴病;cox1基因;单倍型
作者姓名:
郭璐;吴小霞;段兰利;王冰洁;徐宁;阿热艾·阿哈太;乌云花;赵莉;班万里;陈云英;余婉蓉;刘帅;潘星羽;吾力江·卡马力;徐晶;穆尼拉·特列吾汗;张壮志
作者机构:
新疆农业大学动物医学学院,乌鲁木齐830052;吉林大学动物医学学院,长春 130062;新疆畜牧科学院兽医研究所/新疆畜牧科学院动物临床医学研究中心,乌鲁木齐830011;辽宁省农业发展服务中心,沈阳 110032;塔城地区动物疾病控制与诊断中心,塔城834700;新疆博尔塔拉蒙古自治州博乐市畜牧兽医站,博乐833400;昌吉市动物疾病预防控制中心,昌吉831100;伊犁哈萨克自治州动物疾病控制与诊断中心,伊犁835000
引用格式:
[1]郭璐;吴小霞;段兰利;王冰洁;徐宁;阿热艾·阿哈太;乌云花;赵莉;班万里;陈云英;余婉蓉;刘帅;潘星羽;吾力江·卡马力;徐晶;穆尼拉·特列吾汗;张壮志-.新疆部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况调查及基因多态性分析)[J].中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2022(05):603-609
A类:
Popart,DnaSPv5,MN886258,MG280957,KX020359,MG672143,MG682532
B类:
细粒棘球蚴感染,感染情况调查,基因多态性,多态性分析,新疆维吾尔自治区,细粒棘球蚴病,伊宁市,阿勒泰市,塔城市,昭苏县,特克斯县,额敏县,博乐市,定点屠宰,屠宰场,肺脏,肉眼,触摸,包囊,细粒棘球绦虫,细胞色素氧化酶,cox1,GenBank,下载,G1,G3,G4,G5,BLAST,MEGA,邻接,接法,建系,系统进化树,软件构建,网络图,多态性位点,SPSS17,统计学分析,脏器,感染率,x2,bp,条带,a2,羊肝,合并感染,牛肝,基因型,同源性,树上,单倍型分析,基因序列,Hap,变异位点,序列比对,碱基
AB值:
0.240349
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