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典型文献
4份临床样品中羊口疮病毒F1L、B2L和GIF基因的进化分析
文献摘要:
[目的] 研究2021年福建省部分羊场羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)分子流行病学情况.[方法] 对2021年采集的4份病料经PCR鉴定ORFV阳性的临床样品分别克隆其F1L、B2L和GIF基因,将获得的克隆质粒送往测序公司进行测序,将测序拼接后的序列上传至GenBank数据库中,利用生物信息学软件进行对比分析.[结果] 4份临床样品中ORFV的F1L、B2L和GIF基因核苷酸序列相似性分别为98.0%~98.8%、98.4%~99.5%和97.2%~99.6%;与国内流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.4%~99.4%、97.4%~99.9%和95.7%~99.0%;与国外流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.5%~98.6%、97.9%~98.9%和95.6%~98.0%;与德国D1701弱毒株核苷酸序列相似性分别为96.5%~96.8%、98.0%~98.7%和96.0%~96.4%,与NZ2参考株核苷酸序列相似性分别为97.7%~98.1%、97.5%~98.1%和95.9%~96.1%.遗传进化树结果显示4份临床样品中ORFV与吉林(NA17、SY17和CL18株)、福建SJ1株和印度MP株亲缘关系较近;与美国OV-IA82株、德国D1701弱毒株、新西兰NZ2参考株和中国疫苗株亲缘关系较远;表明当前流行毒株可能是本省毒株、国内吉林GZ18株和国外印度MP株的重组毒株.[结论] 获得4份临床样品中ORFV B2L、F1L和GIF基因序列并上传至GenBank数据库中,丰富了ORFV相关基因序列的数据库,同时阐明福建省部分羊场当前ORFV的流行特征,为福建省今后有效防控Orf提供理论依据.
文献关键词:
羊口疮病毒;F1L基因;B2L基因;GIF基因;进化分析
作者姓名:
林裕胜;刘维巍;张龙;江锦秀;张靖鹏;刘庆华;胡奇林
作者机构:
福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福建 福州 350013;福建农林大学动物科学学院,福建 福州 350002
文献出处:
引用格式:
[1]林裕胜;刘维巍;张龙;江锦秀;张靖鹏;刘庆华;胡奇林-.4份临床样品中羊口疮病毒F1L、B2L和GIF基因的进化分析)[J].福建农业学报,2022(06):748-753
A类:
D1701,NZ2,NA17,SY17,CL18,SJ1,IA82,GZ18
B类:
羊口疮病毒,F1L,B2L,GIF,进化分析,羊场,Orf,virus,ORFV,分子流行病学,别克,质粒,送往,拼接,列上,GenBank,利用生物,生物信息学软件,内流,流行毒株,外流,遗传进化树,MP,亲缘关系,OV,新西兰,疫苗株,较远,本省,重组毒株,基因序列,明福,流行特征
AB值:
0.229612
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