典型文献
妊娠期高血压患者子代胎盘组织中长非编码RNA表达差异分析
文献摘要：
目的 基于高通量测序技术检测健康产妇与妊娠期高血压产妇子代胎盘组织中长非编码RNA(lncRNA)的差异表达情况,以探讨妊娠期高血压早期潜在生物学标志物及发病机制.方法 选取在武警特色医学中心妇产科2018年1—6月收治的健康产妇(C组)及妊娠期高血压产妇(M组).提取2组胎盘组织总RNA行高通量测序,数据评估与质控后,以差异倍数|Fold Change|>2且Q值<0.05为标准判断2组表达差异的lncRNA,同时预测其靶基因,对差异表达的lncRNA对应靶基因进行GO富集分析、KEGG通路富集分析和蛋白相互作用分析.结果 C1～3组分别读取53325958、58331146、52276474条序列,M1～3组共读取50851088、49712562、59418802条序列,且最终筛选出具有编码潜能的lncRNA 884个,2组有差异表达的lncRNA共有32个,其中ENST00000492363差异倍数最大.GO富集分析显示,主要富集的生物学过程为多细胞生物过程、细胞成分组织或生物发生、生物过程的负调节、生物调节、发展过程、代谢过程.主要富集的细胞组分为膜腔、细胞器部分、胞外区、单元格部分、胞外区部分、细胞器、细胞外基质;主要富集的分子功能为转录因子活性、结合、催化活性,信号传感器富集基因数>40个的通路共有41条,包括12条代谢相关通路、10条有机体系统相关通路、8条人类疾病相关通路、4条细胞过程相关通路、4条遗传信息通路、3条环境信息相关通路.处于网络核心位置的基因主要包括PSMF1、DDX6、RPS27A、PSMB10、CASP10、GNB2L1、RELA、EIF4G1等.临床验证结果显示,妊娠期高血压产妇子代胎盘组织中ENST00000492363表达水平显著高于正常妊娠产妇子代胎盘组织(P<0.05).结论 胎盘组织中lncRNA的差异表达与妊娠期高血压相关,其中ENST00000492363表达上调且差异倍数最大;lncRNA靶基因可能主要通过调节物质代谢通路发挥作用,同时PSMF1、DDX6、RPS27A、PSMB10、CASP10、GNB2L1、RELA、EIF4G1等基因处于网络调控中心,可能与妊娠期高血压发生发展具有相关性.
文献关键词：
高血压;妊娠性;长非编码RN;胎盘;富集分析;高通量核苷酸序列分析;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
高永宁;刘珍珍;李玉明;胡金朋
作者机构：
300162 天津,武警特色医学中心儿科;722299 陕西 扶风,扶风县人民医院神经内科;300162 天津,武警特色医学中心研究部
文献出处：
引用格式：
[1]高永宁;刘珍珍;李玉明;胡金朋-.妊娠期高血压患者子代胎盘组织中长非编码RNA表达差异分析)[J].解放军医药杂志,2022(03):58-68
A类：
ENST00000492363,PSMF1,DDX6,PSMB10,CASP10,EIF4G1
B类：
妊娠期高血压患者,子代,胎盘组织,长非编码,表达差异,高通量测序技术,健康产妇,高血压产妇,lncRNA,差异表达,生物学标志物,武警,医学中心,妇产科,数据评估,质控,倍数,Fold,Change,靶基因,通路富集分析,蛋白相互作用,相互作用分析,C1,读取,M1,共读,生物学过程,多细胞,生物过程,细胞成分,生物发生,代谢过程,细胞器,胞外区,单元格,细胞外基质,催化活性,信号传感器,相关通路,有机体,人类疾病,疾病相关,遗传信息,环境信息,RPS27A,GNB2L1,RELA,临床验证,正常妊娠,节物,物质代谢,代谢通路,调控中心,妊娠性,高通量核苷酸序列分析
AB值：
0.261521
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