典型文献
基于网络药理学探讨冬虫夏草治疗糖尿病肾病的作用机制
文献摘要:
目的 通过网络药理学探讨冬虫夏草治疗糖尿病肾病方面的作用机制研究.方法 首先利用TCMSP平台检索冬虫夏草的化学成分和作用靶点,并通过GeneCards、OMIM、TTD和CTD等数据库筛选出治疗糖尿病肾病的靶标,借助Uniprot数据库对靶点进行基因注释,基于STRING 10.0构建PPI蛋白互作网络,通过R语言中的Bioconductor平台数据包中的org.Hs.eg.db对基因进行编码;再使用R语言插件中的stringi、col-orspace 以及 Bioconductor 平台中的 clusterProfiler、DOSE、pathview 三个数据包,进行基因本体(Gene ontology,GO)分析和基于京都基因与基因百科全书(KEGG)信号通路富集分析;取药物-疾病交集基因通过Cytoscape3.7.2构建药物-化合物-靶点网络,最后将网络中度值较高的成分与核心靶点进行分子对接.结果 筛选出冬虫夏草7个活性成分,糖尿病肾病靶点共2 987个,其中糖尿病肾病-冬虫夏草共同作用靶点41个,GO条目863条,其中生物过程共775条,细胞组成共27条,分子功能共61条;KEGG信号通路共133条,涉及细胞凋亡、癌症、炎症等信号通路;分子对接结果显示主要活性成分与靶点均能自发结合.结论 该研究初步揭示了冬虫夏草通过多成分-多靶点-多通路治疗糖尿病肾病的作用机制,为冬虫夏草的机制研究提供理论依据.
文献关键词:
冬虫夏草;网络药理学;作用机制;糖尿病肾病
中图分类号:
作者姓名:
邢磊;邢文文;张澍鸿
作者机构:
211300 南京市高淳中医院老年病科
文献出处:
引用格式:
[1]邢磊;邢文文;张澍鸿-.基于网络药理学探讨冬虫夏草治疗糖尿病肾病的作用机制)[J].中国疗养医学,2022(04):358-363
A类:
stringi,orspace
B类:
网络药理学,冬虫夏草,治疗糖尿病肾病,TCMSP,作用靶点,GeneCards,OMIM,TTD,CTD,靶标,Uniprot,对靶,基因注释,STRING,PPI,蛋白互作网络,言中,Bioconductor,平台数据,数据包,org,Hs,eg,db,插件,col,clusterProfiler,DOSE,pathview,基因本体,ontology,京都,百科全书,信号通路富集,通路富集分析,取药,交集,Cytoscape3,靶点网络,核心靶点,分子对接,条目,生物过程,细胞组成,主要活性成分,发结,多成分,多靶点,多通路
AB值:
0.352381
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