典型文献
生防菌Bacillus subtilis DNKAS全基因组测序及生物膜形成相关基因分析
文献摘要：
为深入挖掘和利用枯草芽孢杆菌及其基因资源,本研究利用BGISEQ-50平台对一株具有生防潜力的B.subtilis DNKAS进行了全基因组测序,通过基因组装、基因预测和功能注释,与其他8株枯草芽孢杆菌进行了比较基因组分析.结果显示:DNKAS基因组大小为4.15Mb,GC含量为43.42％,预测编码基因4 359个.在DNKAS基因组中注释到4 217个基因具有直系同源蛋白簇分类.比较基因组分析表明:DNKAS符合枯草芽孢杆菌基因组的基本特征,与其他8株枯草芽孢杆菌共有1 354个同源基因.DNKAS中与生物膜形成相关基因26个,其中编码XRE家族转录调控因子、HTH型转录调控基因等涉及生物膜通透性、脂类合成相关基因均与B.subtilis NCD-2对应的功能基因相同,两株菌在PTS系统,糖特异性IIA成分基因存在较大差异.对DNKAS全基因组序列的注释和功能分析,为深入研究其定殖特性和作用机制,并更有效地利用其防控杂草列当提供了基础.
文献关键词：
枯草芽孢杆菌;全基因组测序;比较基因组;生物膜
中图分类号：
作者姓名：
王骞;包慧芳;丁荣荣;史应武;杨红梅;楚敏;王宁
作者机构：
新疆维吾尔自治区土壤肥料工作站,乌鲁木齐 830006;新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物重点实验室,乌鲁木齐 830091;新疆生产建设兵团第七师农业科学研究所,新疆 奎屯 833200
文献出处：
引用格式：
[1]王骞;包慧芳;丁荣荣;史应武;杨红梅;楚敏;王宁-.生防菌Bacillus subtilis DNKAS全基因组测序及生物膜形成相关基因分析)[J].草食家畜,2022(05):56-64
A类：
DNKAS,15Mb,XRE
B类：
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AB值：
0.28759
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