典型文献
SPP1在头颈部鳞状细胞癌的免疫浸润及临床相关性分析
文献摘要：
探讨分泌型磷蛋白1(Secreted Phosphoprotein 1,SPP1)在头颈部鳞状细胞癌(Head and neck squamous cell carcinoma,HNSC)中与免疫浸润及临床的相关性,明确SPP1在HNSC预后和个体化治疗中的潜在价值.使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)HNSC数据分析SPP1表达.使用来自TCGA的临床生存数据评估SPP1的临床预后价值.使用R语言的clusterProfiler包进行SPP1相关的富集分析.使用R语言的CIBERSORT函数评估22种肿瘤浸润免疫细胞在HNSC中的浸润情况,分析肿瘤浸润免疫细胞与SPP1表达之间的关联.差异表达分析发现SPP1在HNSC中高表达(P<0.001),临床相关性分析发现SPP1表达与T分期(P=0.001)、临床分期(P=0.013)相关,SPP1高表达患者的总生存期明显短于低表达患者(P=0.0204).基因富集分析发现SPP1在HNSC中与免疫学功能及免疫相关通路有关联.肿瘤浸润免疫细胞分析发现在高SPP1表达组中,M2巨噬细胞(P=0.0011)、未活化树突状细胞(P=0.0055)、活化肥大细胞(P=0.0488)浸润比例增加,而活化记忆性CD4+T淋巴细胞(P<0.001)、浆细胞(P=0.0266)、未活化肥大细胞(P=0.0386)浸润比例减少.研究表明SPP1在HNSC中充当致癌基因,并与患者的临床结果相关,SPP1在肿瘤免疫微环境中起重要作用,可能成为HNSC中有价值的预后生物标志物及免疫治疗生物靶标.
文献关键词：
头颈部鳞状细胞癌;免疫浸润;肿瘤预后;SPP1;CIBERSORT
中图分类号：
作者姓名：
杨开炎;黄兰诚;林钻平;唐凤珠;李旭祥;冯大益
作者机构：
广西中医药大学瑞康临床医学院,南宁530000;广西壮族自治区人民医院 耳鼻咽喉头颈科,南宁530000;广西百色市人民医院 耳鼻咽喉头颈外科,广西 百色533000;广西百色市人民医院 病理科,广西 百色533000
文献出处：
引用格式：
[1]杨开炎;黄兰诚;林钻平;唐凤珠;李旭祥;冯大益-.SPP1在头颈部鳞状细胞癌的免疫浸润及临床相关性分析)[J].生物信息学,2022(04):284-293
A类：
Secreted,Phosphoprotein
B类：
SPP1,头颈部鳞状细胞癌,免疫浸润,临床相关性,磷蛋白,Head,neck,squamous,cell,carcinoma,HNSC,个体化治疗,潜在价值,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,数据评估,临床预后,预后价值,clusterProfiler,CIBERSORT,肿瘤浸润免疫细胞,差异表达分析,临床分期,总生存期,低表达,基因富集分析,免疫学,免疫相关,相关通路,M2,巨噬细胞,树突状细胞,化肥,肥大细胞,浸润比例,记忆性,CD4+T,浆细胞,充当,致癌基因,临床结果,肿瘤免疫微环境,预后生物标志物,免疫治疗,靶标,肿瘤预后
AB值：
0.292383
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