典型文献
基于肿瘤免疫微环境鉴定IDH突变型弥漫性胶质瘤的预后标志物
文献摘要:
异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变存在于大多数低级别胶质细胞瘤中,免疫逃逸是肿瘤标志性特征之一,免疫治疗在胶质瘤的治疗中的作用越来越重要.利用生信手段分析TCGA、CGGA、GEO数据集中IDH突变胶质瘤的770个免疫相关基因及其临床相关数据,从而获得每个患者的免疫风险评分(IMRS);结合IMRS和临床信息,筛选出6个差异表达基因(TRAF3、ATG10、BID、TAB1、MAP3K1、RPS6)组成IMRS模型并生成诺莫图对患者预后进行评估,发现低风险组患者的总生存期(OS)较高风险组均明显延长.此外,签名相关免疫细胞浸润分析发现肿瘤相关巨噬细胞浸润评分(TAM)与肿瘤相关T细胞浸润评分(TIS)呈明显的负相关,表明高IMRS富集了促肿瘤免疫浸润,而低IMRS则富集了相对较多的抗肿瘤免疫浸润.
文献关键词:
免疫微环境;IDH突变型弥漫性胶质细胞瘤;总生存期;免疫浸润评分模型
中图分类号:
作者姓名:
张娇;黄纯海;王钊
作者机构:
吉首大学医学院 湖南 吉首416000;吉首大学第一附属医院/湘西自治州人民医院神经外科 湖南 吉首416000;吉首大学临床转化医学研究中心 湖南 吉首416000
文献出处:
引用格式:
[1]张娇;黄纯海;王钊-.基于肿瘤免疫微环境鉴定IDH突变型弥漫性胶质瘤的预后标志物)[J].生物信息学,2022(02):141-148
A类:
IMRS,ATG10,免疫浸润评分模型
B类:
肿瘤免疫微环境,环境鉴定,IDH,突变型,弥漫性胶质瘤,预后标志物,异柠檬酸脱氢酶,低级,胶质细胞瘤,免疫逃逸,标志性特征,免疫治疗,生信,信手,TCGA,CGGA,GEO,免疫相关基因,临床相,风险评分,临床信息,差异表达基因,TRAF3,BID,TAB1,MAP3K1,RPS6,诺莫图,低风险组,总生存期,OS,高风险组,签名,名相,相关免疫,免疫细胞浸润,肿瘤相关巨噬细胞,巨噬细胞浸润,TAM,TIS,肿瘤免疫浸润,抗肿瘤免疫
AB值:
0.371047
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