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典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探讨芪归药对调控肿瘤免疫微环境的机制
文献摘要:
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨芪归药对调控肿瘤免疫微环境(tumor immune microenviroment,TIME)的机制和物质基础.方法:通过TCMSP数据库筛选黄芪、当归的有效活性成分及相关靶点蛋白,将经GeneCards数据库挖掘的TIME相关靶标与药物靶点蛋白交集;运用Cytoscape 3.7.1软件构建活性成分-靶点-疾病网络图,运用STRING数据库构建交集靶点的PPI网络并拓扑分析核心靶点,运用David数据库进行KEGG通路和GO功能富集分析;利用Auto Dock Vina软件将主要活性成分、阳性对照药与核心靶蛋白进行分子对接、PyMol 2.3软件绘制对接模式图.结果:筛选出芪归药对的有效活性成分18个,靶点蛋白100个,芪归药对与TIME的交集靶点79个,分析得到78条KEGG富集通路、304条GO功能富集条目,涉及microRNA、PI3K/Akt、TNF、MAPK、HIF-1等通路及炎症、增殖凋亡、缺氧等生物过程;活性成分槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇与IL-6、VEGF、EGFR、CAPS3、MAPK8等潜在核心靶点蛋白均存在较强的分子对接关系.结论:初步揭示了芪归药对可通过多成分、多途径和多靶点协同调节TIME的作用机制,为临床筛选调节TIME药物提供可靠理论依据.
文献关键词:
芪归药对;肿瘤免疫微环境;网络药理学;分子对接
作者姓名:
郑倩倩;陈璐瑶;何欢;侯梦雪;牛芯蕊;王晓玲;汪涛
作者机构:
天津中医药大学,天津 301617
文献出处:
引用格式:
[1]郑倩倩;陈璐瑶;何欢;侯梦雪;牛芯蕊;王晓玲;汪涛-.基于网络药理学和分子对接技术探讨芪归药对调控肿瘤免疫微环境的机制)[J].中医药信息,2022(05):27-33
A类:
microenviroment,CAPS3
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,芪归药对,肿瘤免疫微环境,tumor,immune,TIME,TCMSP,黄芪,当归,靶点蛋白,GeneCards,靶标,药物靶点,Cytoscape,软件构建,网络图,STRING,数据库构建,建交,交集靶点,PPI,拓扑分析,核心靶点,David,功能富集分析,Auto,Dock,Vina,主要活性成分,阳性对照,核心靶蛋白,PyMol,对接模式,模式图,富集通路,集条,条目,microRNA,PI3K,Akt,HIF,增殖凋亡,生物过程,槲皮素,山柰酚,谷甾醇,VEGF,EGFR,MAPK8,多成分,多途径,多靶点,同调,选调
AB值:
0.360306
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