典型文献
基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物
文献摘要：
目的 探寻冠状动脉性猝死(sudden coronary death,SCD)大鼠心肌组织信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,为SCD的法医学鉴定提供思路.方法 建立SCD大鼠模型,利用二代测序技术进行转录组测序;用R软件limma包筛选SCD大鼠心肌组织中差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件对DEG构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并基于cytoHubba插件筛选相关hub基因.用R软件clusterProfiler包对筛选到的DEG进行生物学功能和信号通路富集分析.结果 共有177个DEG与SCD相关,主要参与肾素-血管紧张素系统、PI3K-Akt信号通路等.血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)、补体成分4a(C4a)、Fos原癌基因(Fos proto-oncogene,FOS)等基因在SCD的发生发展过程中发挥关键作用.结论 AGT、C4a、FOS等基因有望成为鉴定SCD的潜在生物标志物,基于mRNA表达谱的研究可为SCD的法医学鉴定提供参考.
文献关键词：
法医病理学;冠状动脉性猝死;信使RNA;差异表达基因;生物标志物;心肌缺血;死亡原因;大鼠
中图分类号：
作者姓名：
郭相杰;李昊;白雅琴;吴鹏;赵春梅;董祎铭;陈念念;贠克明;高彩荣
作者机构：
山西医科大学法医学院,山西 晋中 030600
文献出处：
引用格式：
[1]郭相杰;李昊;白雅琴;吴鹏;赵春梅;董祎铭;陈念念;贠克明;高彩荣-.基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物)[J].法医学杂志,2022(04):443-451
A类：
冠状动脉性猝死
B类：
心肌组织,表达谱,sudden,coronary,death,SCD,信使,messenger,法医学鉴定,大鼠模型,二代测序技术,转录组测序,limma,差异表达基因,differentially,expressed,DEG,STRING,Cytoscape,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,cytoHubba,插件,选相,hub,clusterProfiler,生物学功能,信号通路富集,通路富集分析,肾素,血管紧张素,PI3K,Akt,angiotensinogen,AGT,补体成分,C4a,Fos,原癌基因,proto,oncogene,FOS,潜在生物标志物,法医病理学,心肌缺血,死亡原因
AB值：
0.347253
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