典型文献
一种基于加权非负最小二乘的蛋白质定量方法
文献摘要：
目的 提出一种综合利用肽段信息的蛋白质定量方法WeQuant(weighted peptide-based protein quantification),以提高蛋白质定量的通量与准确度,特别是低丰度蛋白质.方法 基于肽段和蛋白质的关系,按照肽段的丰度与来源对所有肽段进行加权,并利用肽段和蛋白质的等量关系建立加权非负最小二乘模型,从而得到蛋白质的相对丰度.结果 与传统蛋白质定量方法相比,WeQuant在实验数据集上显著增加了有效定量的蛋白质数量,并在不同丰度范围均达到了更高的定量准确度.此外,WeQuant能够有效定量未被其他方法报告的低丰度蛋白质.结论 本文提出的基于加权非负最小二乘的模型能够克服对高丰度肽段和唯一肽段的依赖,实现对不同丰度范围的蛋白质进行准确定量.
文献关键词：
定量蛋白质组学;质谱;加权非负最小二乘;相对定量;无标记
中图分类号：
作者姓名：
方言;郑浩然
作者机构：
中国科学技术大学计算机科学与技术学院 合肥230027
文献出处：
引用格式：
[1]方言;郑浩然-.一种基于加权非负最小二乘的蛋白质定量方法)[J].北京生物医学工程,2022(01):62-67
A类：
加权非负最小二乘,WeQuant
B类：
蛋白质定量,定量方法,weighted,peptide,protein,quantification,高蛋白质,等量关系,最小二乘模型,相对丰度,质数,其他方法,高丰度,准确定量,定量蛋白质组学,相对定量,无标记
AB值：
0.25237
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