典型文献
基于同位素标记的相对和绝对定量的糖尿病并发肺结核患者血浆蛋白质组学研究
文献摘要:
目的:比较糖尿病(diabetes mellitus,DM)患者与糖尿病并发肺结核(diabetes mellitus complicated with pulmonary tuberculosis,DM-PTB)患者的血浆蛋白质谱差异,筛选DM-PTB潜在蛋白质生物标志物,为进一步探索DM-PTB的发病机制提供思路.方法:采用回顾性研究的方法,选取于2017年1月至2018年1月在黑龙江省传染病防治院确诊的DM患者和DM-PTB患者各16例,采用基于同位素标记的相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白质组学技术分析两组间血浆蛋白质谱,以DM-PTB组对DM组蛋白表达量变化倍数>1.2或<0.83且P<0.05为标准筛选差异蛋白,并对差异蛋白进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析等生物信息学分析.结果:共筛选出275个差异表达蛋白,其中有111个在DM-PTB组上调,有164个在DM-PTB组下调.GO分析显示,差异表达蛋白富集数目最多的生物学过程为细胞过程(92.00%,253/275),定位于细胞器(87.27%,240/275),分子功能为结合(90.55%,249/275).KEGG代谢通路分析显示,差异表达蛋白共富集到26条代谢通路(错误发现率<0.05),富集数目最多的通路为黏着斑通路(22个蛋白),此外PI3K-Akt信号通路、胆固醇代谢通路、血小板激活通路、吞噬体通路和补体及凝血通路等与糖脂代谢和免疫相关的通路也发生了变化.结论:本研究通过iTRAQ蛋白质组学方法筛选出了 DM-PTB患者的差异表达蛋白,发现这些差异表达蛋白参与了与细胞活动、糖脂代谢和免疫调节相关的信号通路,提示上述通路的变化可能与DM-PTB的发病密切相关.
文献关键词:
糖尿病;结核;肺;同位素标记;蛋白质组学;血浆
中图分类号:
作者姓名:
吴明歧;闫世春;刘玉琴;郭鑫;王美杰;田晶;侯绍英
作者机构:
哈尔滨医科大学公共卫生学院营养与食品卫生学教研室,哈尔滨150081;黑龙江省疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防与控制所,哈尔滨150030;黑龙江省传染病防治院,哈尔滨150500
文献出处:
引用格式:
[1]吴明歧;闫世春;刘玉琴;郭鑫;王美杰;田晶;侯绍英-.基于同位素标记的相对和绝对定量的糖尿病并发肺结核患者血浆蛋白质组学研究)[J].中国防痨杂志,2022(05):442-449
A类:
同位素标记的相对和绝对定量
B类:
肺结核患者,血浆蛋白,组学研究,diabetes,mellitus,DM,complicated,pulmonary,tuberculosis,PTB,生物标志物,回顾性研究,黑龙江省,传染病防治,isobaric,tags,relative,absolute,quantitation,iTRAQ,蛋白质组学技术,组蛋白,倍数,差异蛋白,基因本体,Ontology,功能注释,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,生物信息学分析,差异表达蛋白,生物学过程,细胞器,代谢通路分析,共富集,错误发现率,黏着斑,PI3K,Akt,胆固醇代谢,血小板激活,吞噬体,补体,糖脂代谢,免疫相关,路也,白参,免疫调节
AB值:
0.275486
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