目的 通过对癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)和GTEx数据库中胶质瘤和正常脑组织的基因测序数据进行挖掘,探讨GAS2L3在正常脑组织和不同等级的胶质瘤中差异及其可能对胶质瘤细胞的影响,以期建立胶质瘤治疗的新靶点.方法 通过基因表达谱交互分析(GEPIA)网站分析TCGA和GTEx数据库中GAS2L3在高级别胶质瘤和低级别胶质瘤与正常脑组织中的表达差异.从TCGA数据库中获取702例胶质瘤组织的RNA测序数据与临床信息,首先分析GAS2L3与胶质瘤的等级与预后的相关性;其次通过单因素与多因素的回归分析分析GAS2L3的风险比;最后通过相关性分析计算GAS2L3与增殖、侵袭、凋亡和血管形成的相关性.在以上数据中,按照logFC＞1且P＜0.05的标准筛选GAS2L3高表达与GAS2L3低表达胶质瘤中的差异表达基因,并通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析其在胶质瘤中的调控方式,基因集富集分析(GSEA)其对细胞信号通路的影响.结果 通过GEPIA网站分析发现GAS2L3表达量在低级别胶质瘤与正常脑组织无明显差异,但高表达于胶质母细胞瘤中.GAS2L3在TCGA胶质瘤数据中与胶质瘤的等级正相关,与胶质瘤的预后负相关.单因素与多因素的回归分析发现GAS2L3是胶质瘤预后的不良因素.相关性分析显示GAS2L3与胶质瘤的增殖明显相关.在GAS2L3高表达与低表达胶质瘤中发现2 887个差异基因,GO和KEGG富集其影响的信号通路,GSEA分析发现GAS2L3激活细胞周期信号通路.结论GAS2L3基因可能在胶质瘤的诊断和临床治疗中有重要的意义.

胶质瘤;GAS2L3;生物信息学;差异分析

石爽;钟佳成;刘备;张彪;杨彪;牛文勇;李柏成;覃川;钟东;张正保

402360重庆,重庆市大足区人民医院神经外科;重庆医科大学附属第一医院神经外科

临床神经外科杂志

[1]石爽;钟佳成;刘备;张彪;杨彪;牛文勇;李柏成;覃川;钟东;张正保-.基于生物学信息技术分析GAS2L3在胶质瘤中的表达及意义)[J].临床神经外科杂志,2022(02):142-147,155

GAS2L3

肿瘤基因,基因图谱,TCGA,GTEx,脑组织,基因测序,序数,不同等级,胶质瘤细胞,新靶点,基因表达谱,交互分析,GEPIA,高级别胶质瘤,低级别胶质瘤,表达差异,临床信息,风险比,血管形成,上数,logFC,低表达,差异表达基因,基因本体,京都基因与基因组百科全书,调控方式,基因集富集分析,GSEA,细胞信号通路,胶质母细胞瘤,不良因素,差异基因,活细胞,细胞周期信号通路

0.211449