典型文献
Ⅰ型胶原蛋白α2链在脑胶质瘤中的表达及其对胶质瘤迁移和侵袭的影响
文献摘要:
目的:通过对胶质瘤公共数据的挖掘研究Ⅰ型胶原蛋白α2链(COL1A2)在胶质瘤中的表达和临床意义,并通过基础细胞功能实验验证其对胶质瘤细胞系迁移和侵袭的影响。方法:通过对Oncomine数据库中与COL1A2相关数据的深入发掘,对其在不同类型肿瘤及不同级别和不同分子分型胶质瘤中的表达情况进行荟萃分析,接下来使用中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库进行挖掘,分析COL1A2表达量与胶质瘤患者预后之间的联系。使用基因本体论(GO)和Pathway方法对COL1A2基因进行功能注释,最后通过构建过表达和敲减COL1A2的胶质母细胞系细胞株进行细胞功能实验验证其对胶质瘤细胞系迁移和侵袭的影响。结果:Oncomine数据库中共收集关于COL1A2在不同类型肿瘤的研究成果并且差异有统计学意义的研究成果共114项,其中结果显示COL1A2表达增高的研究有103项,表达量较正常组织降低的研究有11项;分析显示在胶质瘤中COL1A2高表达的研究有22项。分析不同级别胶质瘤以及不同分子类型的胶质瘤与对照组相比,COL1A2在各种类型的胶质瘤中高表达,且越高级别胶质瘤其表达量越高(
P<0.01)。通过对CGGA数据库的芯片数据进行深入挖掘发现,在胶质母细胞瘤中高表达COL1A2的患者预后比低表达COL1A2的患者更差(
P<0.05)。接下来通过GO和Pathway注解发现,COL1A2介入基因转录,翻译后修饰,昼夜节律调节等多种生物学进程。通过在胶质母细胞瘤细胞系U87以及T98构建过表达和敲减细胞株进行划痕实验以及transwell细胞功能实验发现COL1A2可以显著促进胶质母细胞瘤细胞系迁移和侵袭能力。
结论:COL1A2在各种类型的胶质瘤组织中高表达,并且生存分析显示COL1A2表达量与胶质母细胞瘤患者预后相关联,通过对胶质母细胞瘤细胞系U87和T98对COL1A2进行敲减和过表达处理发现COL1A2可以促进胶质母细胞瘤细胞系迁移和侵袭能力,综合上述结果推测其或可作为判断胶质母细胞瘤预后的指标以及潜在的生物靶向治疗靶点。
文献关键词:
神经胶质瘤;Ⅰ型胶原蛋白α2链;生物信息学;生物标志物;治疗靶点
中图分类号:
作者姓名:
刘乐;李炽阳;魏伟;金点石;宋憧
作者机构:
大连市中心医院神经外科,大连 116000;广州南方医院神经外科,广州 510500
文献出处:
引用格式:
[1]刘乐;李炽阳;魏伟;金点石;宋憧-.Ⅰ型胶原蛋白α2链在脑胶质瘤中的表达及其对胶质瘤迁移和侵袭的影响)[J].中国医师进修杂志,2022(03):199-206
A类:
B类:
胶原蛋白,迁移和侵袭,公共数据,COL1A2,细胞功能实验,胶质瘤细胞,细胞系,Oncomine,同级,分子分型,荟萃分析,接下来,中国脑胶质瘤基因组图谱,CGGA,基因本体论,Pathway,功能注释,过表达,敲减,细胞株,共收,较正,正常组织,子类,各种类型,高级别胶质瘤,胶质母细胞瘤,低表达,注解,基因转录,翻译后修饰,昼夜节律,律调,U87,T98,划痕实验,transwell,侵袭能力,生存分析,相关联,靶向治疗,治疗靶点,神经胶质瘤,生物标志物
AB值:
0.207949
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