典型文献
应用分子对接技术预测氟伐他汀对胰腺癌细胞作用的关键靶点
文献摘要：
目的 应用生物信息学综合考察氟伐他汀对胰腺癌MiaPaCa-2和PANC-1细胞基因表达谱的影响,并采用分子对接预测关键蛋白靶点.方法 从基因芯片公共数据库中下载氟伐他汀处理胰腺癌MiaPaCa-2和PANC-1细胞的基因表达谱芯片数据,以P<0.05和|logFC|>1为标准,筛选差异表达基因互作关系.采用VennDiagram R包取交集,得到共同差异表达基因;应用clusterProfiler R包,进行GO和KEGG通路富集分析;Cytoscape软件将差异表达基因互作关系可视化并找出潜在的关键基因,采用分子对接软件Autodock Tools-1.5.6将预测得到的关键蛋白靶点与氟伐他汀进行分子对接分析,进一步研究氟伐他汀与靶蛋白的相互作用.结果 20μM氟伐他汀处理48 h后,胰腺癌细胞MiaPaCa-2和PANC-1共同差异表达基因共27个,主要涉及DNA复制、DNA错配修复与重组、染色体凝缩以及胞质分裂等作用.KEGG通路富集分析结果显示,共同差异表达基因主要与嘧啶代谢、p53信号通路和细胞周期等相关.分子对接结果显示,氟伐他汀与EXO1、MCM10、CDC45和KIF14这4个蛋白靶点之间具有较低的结合自由能,结合稳定.结论 氟伐他汀能够影响胰腺癌细胞MiaPaCa-2和PANC-1细胞基因表达谱.EXO1、MCM10、CDC45和KIF14可能是氟伐他汀治疗胰腺癌潜在的作用靶点.
文献关键词：
氟伐他汀;胰腺癌;分子对接;基因表达;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
朱秀贤;杨舜娟;林菁红;甘惠贞
作者机构：
中国人民解放军联勤保障部队第910医院药剂科,福建 泉州362000
文献出处：
引用格式：
[1]朱秀贤;杨舜娟;林菁红;甘惠贞-.应用分子对接技术预测氟伐他汀对胰腺癌细胞作用的关键靶点)[J].实用药物与临床,2022(12):1057-1063
A类：
MiaPaCa
B类：
分子对接技术,技术预测,氟伐他汀,胰腺癌细胞,关键靶点,PANC,关键蛋白,蛋白靶点,基因芯片,公共数据库,下载,基因表达谱芯片,logFC,差异表达基因,基因互作,互作关系,VennDiagram,交集,clusterProfiler,通路富集分析,Cytoscape,关系可视化,关键基因,Autodock,Tools,靶蛋白,错配修复,凝缩,胞质分裂,嘧啶,p53,细胞周期,EXO1,MCM10,CDC45,KIF14,结合自由能,作用靶点
AB值：
0.268233
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