典型文献
基于TCGA数据库分析SLC5A1在胰腺癌中的表达及潜在促癌作用
文献摘要:
目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析溶质载体家族5?成员1(solute carrier family 5?member 1,SLC5A1)在胰腺癌中的表达及其与临床病理、预后的相关性,探索其在胰腺癌发生、进展中的作用.方法 利用GEPIA分析TCGA数据库中胰腺癌数据,比较SLC5A1在胰腺癌及正常胰腺组织中的表达情况,同时利用LinkedOmics和GEPIA分析其在胰腺癌中表达与不同临床病理特征的相关性;利用cBioPortal和LinkedOmics分析胰腺癌中与SLC5A1表达相关的基因,并利用DAVID和KEGG进行信号通路聚类;探讨SLC5A1与胰腺癌不同基因亚型标志物表达的相关性.结果 SLC5A1 mRNA表达在胰腺癌组织显著高于非胰腺癌组织(P<0.05).在胰腺癌中与SLC5A1高表达相关的基因大多位于细胞膜和细胞核,负责蛋白和离子的结合,参与细胞生物功能、代谢调节,其高表达与葡萄糖摄取、糖酵解/糖异生、胰腺分泌等的基因信号通路呈正相关.SLC5A1的表达与胰腺癌异常分化的内分泌外分泌(aberrantly differentiated endocrine exocrine,ADEX)亚型的胰岛素(insulin,INS)、核受体亚家族5?组A?成员2(nuclear receptor subfamily 5?group A?member 2,NR5A2)和蛋白酶?丝氨酸?3(protease?serine?3,PRSS3)表达呈正相关,差异有统计学意义;与胰腺祖细胞型叉头框A3(forkhead box A3,FOXA3)、肝细胞核因子1α(hepatocyte nuclear factor 1?alpha,HNF1A)、叉头框A2(forkhead box A2,FOXA2)、肝细胞核因子1β(hepatocyte nuclear factor 1β,HNF1B)、胰十二指肠同源框因子?1(pancreatic and duodenal homeobox 1,PDX1)、肝细胞核因4?γ(hepatocyte nuclear factor 4?gamma,HNF4G)、肝细胞核因子4?α(hepatocyte nuclear factor 4?alpha,HNF4A)、多毛和增强子断裂1(hairy and enhancer of split 1,HES1)表达均呈正相关,且差异有统计学意义(P<0.05).结论 SLC5A1在胰腺癌中高表达;其高表达与葡萄糖摄取、糖酵解、胰腺分泌的基因信号通路呈正相关,与胰腺癌祖细胞亚型及ADEX亚型密切相关.
文献关键词:
胰腺癌;胰腺导管癌;钠糖共转运蛋白-1;溶质载体家族5-成员1;癌症基因组图谱
中图分类号:
作者姓名:
陈谱;袁黎玥;雷雨阳;张曈欣;袁佳;郭辉;施秉银;强薇
作者机构:
710061 陕西 西安,西安交通大学第一附属医院内分泌科;西安交通大学第一附属医院心血管内科;民航西安医院急诊科
文献出处:
引用格式:
[1]陈谱;袁黎玥;雷雨阳;张曈欣;袁佳;郭辉;施秉银;强薇-.基于TCGA数据库分析SLC5A1在胰腺癌中的表达及潜在促癌作用)[J].海军医学杂志,2022(07):708-714
A类:
SLC5A1,ADEX,PRSS3,FOXA3,HNF4G,胰腺导管癌
B类:
TCGA,数据库分析,促癌作用,癌症基因组图谱,cancer,genome,atlas,溶质载体,solute,carrier,member,GEPIA,胰腺组织,LinkedOmics,临床病理特征,cBioPortal,DAVID,基因亚型,胰腺癌组织,细胞膜,细胞核,生物功能,代谢调节,葡萄糖摄取,糖酵解,糖异生,基因信号通路,外分泌,aberrantly,differentiated,endocrine,exocrine,insulin,INS,核受体,亚家族,nuclear,receptor,subfamily,group,NR5A2,丝氨酸,protease,serine,祖细胞,叉头框,forkhead,肝细胞,核因子,hepatocyte,alpha,HNF1A,FOXA2,HNF1B,十二指肠,pancreatic,duodenal,homeobox,PDX1,gamma,HNF4A,多毛,增强子,hairy,enhancer,split,HES1,细胞亚型,转运蛋白
AB值:
0.332116
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