典型文献
基于网络药理学联合生物信息学与WGCNA分析探讨半夏白术天麻汤治疗急性脑梗死的分子机制
文献摘要:
本文通过网络药理学、生物信息学、WGCNA分析及分子对接方法从分子层面探究半夏白术天麻汤治疗急性脑梗死的作用机制.通过TCMSP数据库获取半夏白术天麻汤所含化学成分及靶点.在GEO数据库中搜索并下载急性脑梗死相关芯片并提取差异IncRNA;利用WGCNA分析得到关键差异IncRNA,并通过Starbase数据库预测miRNA,miRDB、ENCORI和Targetscan数据库预测mRNA,取交集后得到疾病靶点,与药物靶点相互映射后得到治疗靶点;STRING 11.5数据库进行PPI分析,DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析(P<0.05);利用Cytoscape3.8.1软件构建相关网络图,并通过cytoHubba筛选核心靶点;采用MAESTRO 11.5软件进行分子对接验证.结果显示,共筛选得到半夏白术天麻汤中6味药共计149个活性成分及305个作用靶点,WGCNA将差异IncRNA分为13个共表达模块,其中turquoise模块与高血压相关系数最高(r=0.523),综合筛选得到9个关键IncRNA.PPI分析显示TP53、CASP3和STAT3为关键靶点,GO分析及KEGG通路富集提示,半夏白术天麻汤的作用机制主要涉及细胞增殖、凋亡、转录和血管生成等生物过程,涉及PI3K-Akt、HIF-l和FoxO等信号通路.分子对接结果表明组方中主要活性成分与关键靶点具有较为稳定的结合活性.半夏白术天麻汤可能是通过槲皮素、芹菜素和β谷甾醇等活性成分作用于TP53、CASP3和STAT3等靶点来改善局部脑细胞状态、微血管生成及炎症反应等发挥急性脑梗死的治疗作用.
文献关键词:
急性脑梗死;半夏白术天麻汤;网络药理学;生物信息学;WGCNA;分子对接
中图分类号:
作者姓名:
邹傲霜;刘建仁
作者机构:
广州中医药大学第一临床医学院,广东 广州 510000;广州中医药大学第一附属医院颅脑科,广东 广州 510000
文献出处:
引用格式:
[1]邹傲霜;刘建仁-.基于网络药理学联合生物信息学与WGCNA分析探讨半夏白术天麻汤治疗急性脑梗死的分子机制)[J].特产研究,2022(06):57-68,76
A类:
MAESTRO
B类:
网络药理学,学联,WGCNA,半夏白术天麻汤,急性脑梗死,分子对接,对接方法,TCMSP,所含,含化,GEO,下载,IncRNA,Starbase,miRNA,miRDB,ENCORI,Targetscan,交集,药物靶点,互映,治疗靶点,STRING,PPI,DAVID,富集分析,Cytoscape3,软件构建,网络图,cytoHubba,核心靶点,选得,作用靶点,共表达,turquoise,TP53,CASP3,STAT3,关键靶点,通路富集,生物过程,PI3K,Akt,HIF,FoxO,组方,主要活性成分,结合活性,槲皮素,芹菜素,谷甾醇,成分作用,脑细胞,细胞状,微血管生成,治疗作用
AB值:
0.323296
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