典型文献
自噬相关基因在类风湿关节炎滑膜组织的表达及调控机制
文献摘要：
目的 研究自噬相关基因(ATG)在类风湿关节炎(RA)中的表达调控和自噬机制.方法 从GSE55235和GSE55457中鉴定出RA的差异表达基因(DEG),结合人类自噬数据库,筛选出差异表达自噬相关基因(DE-ATG).利用STRING 11.0和GeneMANIA数据库建立蛋白互作网络.此外,Network Analyst和Cytoscape建立转录因子-基因-miRNA共表达网络.最后,受试者工作特征曲线分析和DrugBank鉴定预测生物标志物的效能和靶向药物的性能.GraphPad prism 8.2.1和R 4.0.3用于统计分析和图形制作.结果 485个DEG在T细胞激活、激素调节、破骨细胞分化、RA和趋化因子等信号通路富集.11个DE-ATG通过hsa-mir-155-5p、RUNX1、TP53和SOX2等调控RA滑膜组织的表达,与四氯二苯二氧芑、二氧化硅有较强的环境因子调控关系.受试者工作特征曲线分析确定了具有良好敏感性和特异性的基因,如MYC、MAPK8、CDKN1A和TNFSF10,可用于区分某些表型,这可能是RA的新型生物标志物.结论 DE-ATG在RA中表达下调可能会促进软骨细胞凋亡和分解,新型生物标志物的确立为诊断和治疗RA提供了新思路和方法,转录因子-基因-miRNA网络的建立为解析滑膜炎症和关节软骨破坏提供直接证据.
文献关键词：
类风湿关节炎;自噬;转录因子;miRNA
中图分类号：
作者姓名：
陈雪芹;李灵兰;付国涛;韩莉欣;毋瑞朋;熊咏民;史传道;刘启玲;张荣强
作者机构：
陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,陕西咸阳712046;陕西省卫生健康委员会疾病控制处,西安710003;西安交通大学公共卫生学院地方病研究所,西安710061;西藏民族大学医学公共卫生与预防医学教研室,陕西咸阳712082
文献出处：
引用格式：
[1]陈雪芹;李灵兰;付国涛;韩莉欣;毋瑞朋;熊咏民;史传道;刘启玲;张荣强-.自噬相关基因在类风湿关节炎滑膜组织的表达及调控机制)[J].中国医学科学院学报,2022(06):950-960
A类：
TNFSF10
B类：
自噬相关基因,类风湿关节炎,滑膜组织,调控机制,ATG,RA,表达调控,自噬机制,GSE55235,GSE55457,差异表达基因,DEG,出差,STRING,GeneMANIA,数据库建立,蛋白互作网络,Network,Analyst,Cytoscape,miRNA,共表达网络,受试者工作特征曲线,DrugBank,靶向药物,GraphPad,prism,形制,细胞激活,激素调节,破骨细胞分化,趋化因子,信号通路富集,hsa,mir,5p,RUNX1,TP53,SOX2,四氯,二氧化硅,环境因子,MYC,MAPK8,CDKN1A,新型生物标志物,软骨细胞凋亡,立为,诊断和治疗,思路和方法,滑膜炎症,关节软骨,软骨破坏
AB值：
0.36617
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
