典型文献
百合病毒的高通量测序鉴定和RT-PCR检测
文献摘要：
为明确百合在生产中被病毒侵染的情况,利用高通量测序技术对云南、浙江等地的百合染病样品进行病毒鉴定,通过序列比对和拼接,获得了车前草花叶病毒(plantago asiatica mosaic virus,PlAMV)、百合斑驳病毒(lily mottle virus,LMoV)、大丽花花叶病毒(dahlia mosaic virus,DMV)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic vi?rus,CMV)、玄参花叶病毒(figwort mosaic virus,FMV)、玫瑰黄脉病毒(rose yellow vein virus,RYVV)、大丽花普通花叶病毒(dahlia common mosaic virus,DCMV)、木薯脉花叶病毒(cassava vein mosaic virus,CsVMV)等8种已知病毒和2种未知病毒的序列信息.对从云南、浙江、江西、上海、广东、湖南6个省(市)采集的48份百合样品进行了上述8种病毒的RT-PCR检测.结果显示,在百合样品中,DMV、RYVV、PlAMV和LMoV发生普遍,检出率均高于95％,FMV检出率高于85％,CMV检出率最低,且仅在云南省昆明市的样品中检出,而DCMV和CsVMV未检测到.检测样品中百合病毒复合侵染率为100％,单一样品检测出3～6种病毒,共有6种复合类型,以云南省昆明市的百合病毒复合侵染情况最复杂,昆明的单一样品均有5～6种病毒感染.以上结果表明,所检测地区百合病毒的检出率和复合侵染率都较高,因此,在生产中应实时监控和检测百合植株的带毒情况,及早发现染病植株,防止病毒扩散和传播,以免造成经济损失.
文献关键词：
百合;病毒;高通量测序;RT-PCR检测;复合侵染
中图分类号：
作者姓名：
袁志豪;李振锋;陆月霞;蔡丽
作者机构：
华中农业大学植物科学技术学院,武汉430070
文献出处：
引用格式：
[1]袁志豪;李振锋;陆月霞;蔡丽-.百合病毒的高通量测序鉴定和RT-PCR检测)[J].华中农业大学学报,2022(03):157-163
A类：
plantago,PlAMV,LMoV,figwort,RYVV,DCMV,CsVMV
B类：
百合病,病毒侵染,高通量测序技术,病毒鉴定,序列比对,拼接,车前草,草花,asiatica,mosaic,virus,斑驳,lily,mottle,大丽花,花花,dahlia,DMV,黄瓜花叶病毒,cucumber,玄参,FMV,玫瑰,rose,yellow,vein,common,木薯,cassava,序列信息,昆明市,未检,检测样品,中百,复合侵染,侵染率,样品检测,测地,实时监控,植株,带毒,毒情,早发现,以免
AB值：
0.270866
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