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激素处理下马尾松茎干组织qPCR内参基因的筛选
文献摘要：
马尾松(Pinus massoniana)的利用价值极高,施加外源激素可促进其茎干的次生生长和木材形成,快速提高生长速度.筛选激素处理下马尾松茎干qPCR实验的最佳内参基因,可为马尾松次生生长的基因表达研究提供技术支持.本研究从马尾松茎干转录组数据库选取14个候选内参基因,利用qPCR技术进行基因表达分析,采用GeNorm、NormFinder和BestKeeper三款软件分析候选内参基因在不同激素—生长素(auxin,IAA)、赤霉素(gibberellin,GA3)和油菜素内酯(brassinolide,BR)处理条件下马尾松茎干中的表达稳定性,并借助目的基因—纤维素合成酶2(cellulose synthase 2,CESA2)对筛选出的内参基因进行验证.结果显示,在不同激素处理下,表达稳定性最佳的内参基因为磷酸胆碱胞二苷酰基转移酶1基因(phosphoate cytidine transferase 1,PCYT1)、泛素结合酶 E2D 基因(ubiquitin-conjugating enzyme E2D,UBE2D)和磷酸葡萄糖变位酶基因(phosphoglucomutase,PGM);目的基因CESA2在激素处理下的表达模式证实上述内参基因组合具有良好的可靠性.本研究筛选的内参基因有助于提高马尾松qPCR实验的准确性和可靠性,为在激素处理下的马尾松基因表达分析提供技术支持.
文献关键词：
马尾松;内参基因;激素处理;qPCR
中图分类号：
作者姓名：
覃慧娟;范付华;周紫晶
作者机构：
贵州大学贵州省森林资源与环境研究中心/贵州省高原山地林木培育重点实验室,贵阳550025;贵州大学林学院,贵阳550025
文献出处：
引用格式：
[1]覃慧娟;范付华;周紫晶-.激素处理下马尾松茎干组织qPCR内参基因的筛选)[J].农业生物技术学报,2022(02):393-401
A类：
CESA2,phosphoate,PCYT1,E2D,UBE2D,phosphoglucomutase
B类：
激素处理,下马,马尾松,茎干,qPCR,内参基因,Pinus,massoniana,利用价值,外源激素,木材形成,高生长,生长速度,表达研究,转录组数据,基因表达分析,GeNorm,NormFinder,BestKeeper,三款,生长素,auxin,IAA,赤霉素,gibberellin,GA3,油菜素内酯,brassinolide,BR,处理条件,表达稳定性,目的基因,纤维素合成酶,cellulose,synthase,胆碱,酰基,基转移酶,cytidine,transferase,泛素结合酶,ubiquitin,conjugating,enzyme,酸葡萄,变位,酶基因,PGM,表达模式,基因组合
AB值：
0.356048
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