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典型文献
生物信息学分析FERMT1在膀胱癌组织中的表达及意义
文献摘要:
目的:生物信息学分析FERMT1在膀胱癌组织中的表达水平及其与病理参数的关系,并进而挖掘其突变信息及调控网络.方法:首先利用GEPIA数据库分析FERMT1在多种癌症中的表达水平,进而利用Oncomine及THPA等在线网站分析膀胱癌组织中FERMT1基因的mRNA及蛋白质表达情况;利用在线UALCAN数据库展现FERMT1与临床病理参数间的关系;cBioPortal在线数据库分析FERMT1基因的突变情况;LinkedOmics软件探究与FERMT1共表达的基因及基因富集分析.结果:FERMT1在多数癌症中呈现高表达,在膀胱癌组织中mRNA及蛋白水平均发生明显上调,且FERMT1表达水平与膀胱癌临床病理参数密切相关;同时,FERMT1基因发生多种类型的拷贝数突变,其中错义突变最为常见;FERMT1与多种基因存在共表达关系,进一步的富集分析展示这些基因在多种生物学过程中发挥重要作用.结论:本研究有效地揭示了FERMT1在膀胱癌组织中的表达信息及潜在的调控网络,为进一步研究FERMT1在膀胱癌组织发生发展中的作用奠定了理论基础.
文献关键词:
膀胱癌;FERMT1;生物信息学分析;预后
作者姓名:
郭小会;李策;宫丽宝;李亚天;车晓芳;曲秀娟
作者机构:
中国医科大学附属第一医院肿瘤内科;辽宁省抗癌药物与生物治疗重点实验室,辽宁沈阳110001;辽宁省肿瘤研究中心,辽宁沈阳110001
文献出处:
引用格式:
[1]郭小会;李策;宫丽宝;李亚天;车晓芳;曲秀娟-.生物信息学分析FERMT1在膀胱癌组织中的表达及意义)[J].现代肿瘤医学,2022(01):71-76
A类:
B类:
生物信息学分析,FERMT1,膀胱癌,癌组织,调控网络,GEPIA,数据库分析,Oncomine,THPA,线网,蛋白质表达,UALCAN,临床病理参数,数间,cBioPortal,LinkedOmics,共表达,基因富集分析,多种类型,拷贝数,错义突变,表达关系,生物学过程,达信
AB值:
0.23694
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