典型文献
铁死亡相关lncRNA在神经胶质瘤的预后价值分析
文献摘要：
通过分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的神经胶质瘤患者的转录组数据与临床数据,应用基因共表达法、单因素Cox回归法筛选与预后有关的铁死亡相关长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),根据LASSO Cox回归分析与筛选出的lncRNA在样本中的表达情况,将样本分为高、低风险两组,通过单因素及多因素独立预后分析、受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,ROC Curve)、Kaplan-Meier生存曲线、风险曲线、基因富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)等方法评估铁死亡相关lncRNA在神经胶质瘤预后中的价值及临床意义,通过TIMER、CIBERSORT、CIBERSORT-ABS等方法分析免疫浸润情况,进一步对免疫功能、免疫检查点以及N6-甲基腺苷(m6 A)甲基化差异进行分析.结果获得预后相关的铁死亡相关lncRNA共14个.单因素及多因素独立预后分析、ROC曲线结果表明,铁死亡相关lncRNA可作为独立的预后因子.Kaplan-Meier生存曲线与风险曲线表明,高风险组的生存时间更短.GSEA结果显示,高风险组中同种异体移植排斥、DNA复制、错配修复等显著活跃,而低风险组长程增强效应、磷脂酰肌醇信号系统显著活跃等,此外,基于不同方法高、低风险组的免疫浸润情况也有所差异,高风险组的大部分免疫检查点表达显著高于低风险组,m6 A相关基因的表达在高、低风险组中也具有显著性差异.本研究表明,铁死亡相关lncRNA与神经胶质瘤患者的生存密切相关,可作为神经胶质瘤预后新的生物标志物和潜在的治疗靶点.
文献关键词：
神经胶质瘤;铁死亡;lncRNA;生物信息学;生物标志物
中图分类号：
作者姓名：
陈伟鸿;吴琪琪;周越菡
作者机构：
桂林医学院药学院,广西桂林 541199
文献出处：
引用格式：
[1]陈伟鸿;吴琪琪;周越菡-.铁死亡相关lncRNA在神经胶质瘤的预后价值分析)[J].广西科学,2022(02):323-333
A类：
B类：
铁死亡,lncRNA,神经胶质瘤,预后价值,价值分析,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,转录组数据,临床数据,共表达,表达法,Cox,回归法,关长,长非编码,long,coding,LASSO,预后分析,受试者工作特征曲线,Receiver,Operating,Characteristic,Curve,Kaplan,Meier,生存曲线,风险曲线,基因富集分析,Gene,Set,Enrichment,Analysis,GSEA,方法评估,TIMER,CIBERSORT,ABS,免疫浸润,免疫检查点,N6,腺苷,m6,甲基化,线结,预后因子,高风险组,生存时间,同种异体移植排斥,错配修复,低风险组,组长,长程,程增强,增强效应,磷脂酰肌醇,信号系统,不同方法,生物标志物,治疗靶点
AB值：
0.34413
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