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典型文献
阿奇霉素及其杂质J对斑马鱼毒性的转录组学分析
文献摘要:
目的 阿奇霉素在酸中的主要降解产物为3'-去克拉定糖阿奇霉素(杂质J).本研究旨在利用模式动物斑马鱼,比较阿奇霉素及其杂质J体内诱导的毒性反应差异.方法 斑马鱼幼鱼(3 dpf)给予不同浓度的阿奇霉素和杂质J,3 d后,计算并比较两种化合物的LD5和LD50;利用转录组学分析,比较阿奇霉素和杂质J导致机体表达谱的变化,并寻找显著性差异基因(DEGs);通过基因本体(GO)数据库对显著性差异基因进行功能归类分析,比较两种化合物对体内生物过程影响的可能差异.结果 阿奇霉素和杂质J对斑马鱼的致死作用相似;二者均可导致幼鱼基因表达谱发生明显改变,但在转录水平可调节的DEGs个数不同;阿奇霉素单独调节的DEGs(ctsc、gnpda、gck和tmmem127),在显著差异性GO生物过程(变化倍数>3,P<0.05)中,主要归类于调控与代谢相关和细胞生长相关的生物过程,而杂质J单独调节的DEGs(cxcl8b.l)在显著差异性GO生物过程中,归类于与免疫调控相关的生物过程;qRT-PCR结果显示验证了阿奇霉素单独调节的ctsc、gnpda、gck和tmem127基因以及杂质J单独调节的cxcl8b.l基因的表达变化与RNA-seq测序结果相似.结论 阿奇霉素和杂质J诱导斑马鱼幼鱼毒性反应的作用机制可能有所不同,为进一步探讨阿奇霉素在临床应用中产生不良反应的机制明确了方向.
文献关键词:
阿奇霉素;杂质J;斑马鱼;毒性;转录组学分析
作者姓名:
陈宁;黄权华;苏军权;张苗青;张靖溥
作者机构:
深圳华润九新药业有限公司,深圳518049;中国医学科学院/北京协和医学院医药生物技术研究所,国家卫生健康委员会抗生素生物工程重点实验室,抗感染药物研究北京市重点实验室,北京100050
文献出处:
引用格式:
[1]陈宁;黄权华;苏军权;张苗青;张靖溥-.阿奇霉素及其杂质J对斑马鱼毒性的转录组学分析)[J].中国抗生素杂志,2022(03):241-244
A类:
LD5,ctsc,gnpda,gck,tmmem127,cxcl8b,tmem127
B类:
阿奇霉素,转录组学分析,降解产物,克拉,利用模式,模式动物,毒性反应,斑马鱼幼鱼,dpf,LD50,差异基因,DEGs,基因本体,归类分析,生物过程,基因表达谱,转录水平,可调节,倍数,细胞生长,长相,免疫调控,qRT,表达变化,seq
AB值:
0.16976
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