典型文献
作物基因编辑效果可视化鉴定软件
文献摘要：
CRISPR编辑系统结合高通量测序,可实现高效评估基因编辑效率和准确度,并在遗传学、生物学、医学等多个领域得到广泛应用.然而,高通量测序数据缺乏一个一键流程化界面工具来实现突变效率和准确度的评估.为此,开发了一个基于Python的可视化工具——作物基因编辑效果可视化鉴定软件.该软件可对高通量基因编辑数据进行批量计算,可一键实现数据的预处理(拆分和合并)、突变类型和效率的检测和可视化图表输出.该软件提供了界面化程序,用户只需鼠标点击即可实现数据的导入和结果的输出.分析结果以多种格式输出,图像支持缩放和颜色更改,方便后期结果整理和撰写论文.此外,该软件安装使用简单,并支持多操作系统(Windows、Linux和MacOS)使用.目前该软件的使用手册和程序包已上传到开放软件平台,方便下载和使用.
文献关键词：
高通量数据;可视化界面;变异计算;基因组编辑效率
中图分类号：
作者姓名：
尤琪;吴文文;姜艺
作者机构：
教育部植物功能基因组学重点实验室/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心,扬州大学 农学院,江苏 扬州 225009
文献出处：
引用格式：
[1]尤琪;吴文文;姜艺-.作物基因编辑效果可视化鉴定软件)[J].浙江农业学报,2022(12):2759-2766
A类：
MacOS,基因组编辑效率
B类：
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AB值：
0.436679
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