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典型文献
基于网络药理学和生物信息学的姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的机制研究
文献摘要:
目的 通过网络药理学和生物信息学挖掘并验证姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的作用机制.方法 从PharmMapper、GeneCards数据库筛选肾透明细胞癌和姜黄素共同靶点基因;应用TCGA数据库数据分析筛选出在肾透明细胞癌组织样本和正常组织样本中的差异表达并影响预后的共同靶点基因;利用STRING平台构建姜黄素-肾透明细胞癌靶点交互网络(protein-protein interaction,PPI);利用R软件对上述筛选靶点蛋白进行GO生物过程分析及KEGG通路富集分析;姜黄素和(或)活性氧抑制剂N-乙酰基-L-半胱氨酸(N-acetyl-L-cysteine,NAC)作用于肾癌786-O、ACHN细胞后,通过CCK8检测不同浓度姜黄素对细胞增殖及细胞活力影响,通过活性氧检测试剂盒(2′,7′-dichlorodihydrofluorescein diacetate,DCFH-DA)检测细胞内活性氧水平,丙二醛(malondialdehyde,MDA)测定试剂盒测定细胞内MDA变化.结果 PharmMapper网站及GeneCards数据库筛选出姜黄素和肾癌共同靶点109个;TCGA数据库数据分析筛选出37个差异基因可能影响患者的总体生存期;PPI筛选出姜黄素抑制肾透明细胞癌生物学行为的核心靶标蛋白主要涉及CASP3、EGFR、CHEK1、HSP90AA1、AR等.GO富集分析确定213个条目,主要包括活性氧代谢过程、对类固醇激素的反应、纤维蛋白溶解等生物活性过程;KEGG富集分析确定24个条目,主要涉及丙酮酸代谢、糖酵解/糖异生、FoxO信号通路、大肠癌、酪氨酸代谢、IL-17信号通路、细胞凋亡等信号通路;姜黄素以时间和剂量依赖性方式降低了786-O、ACHN的细胞活力(P<0.05);姜黄素处理肾癌细胞后活性氧水平及MDA水平显著升高(P<0.05);加入NAC后逆转了姜黄素对786-O和ACHN细胞的细胞活力影响(P<0.05).结论 姜黄素可能参与氧化应激途径抑制肾细胞癌的增殖.
文献关键词:
肾透明细胞癌;姜黄素;氧化应激;增殖;网络药理学;生物信息学
作者姓名:
段万里;翟宇瑶;潘思源;杨海燕;程永毅;孙羿;邓骞
作者机构:
西安交通大学第三附属医院,陕西省人民医院泌尿外科,陕西西安 710068;陕西省感染与免疫重点实验室,陕西西安 710068;西安市第四医院药剂科,陕西西安 710004
引用格式:
[1]段万里;翟宇瑶;潘思源;杨海燕;程永毅;孙羿;邓骞-.基于网络药理学和生物信息学的姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的机制研究)[J].西安交通大学学报(医学版),2022(02):278-285
A类:
B类:
网络药理学,姜黄素,肾透明细胞癌,PharmMapper,GeneCards,靶点基因,TCGA,癌组织,正常组织,差异表达,STRING,平台构建,点交,交互网络,protein,interaction,PPI,靶点蛋白,生物过程,过程分析,通路富集分析,乙酰基,acetyl,cysteine,NAC,ACHN,CCK8,细胞活力,过活,检测试剂盒,dichlorodihydrofluorescein,diacetate,DCFH,细胞内活性氧,活性氧水平,malondialdehyde,差异基因,总体生存期,生物学行为,靶标蛋白,CASP3,EGFR,CHEK1,HSP90AA1,条目,活性氧代谢,代谢过程,类固醇激素,纤维蛋白溶解,丙酮酸代谢,糖酵解,糖异生,FoxO,大肠癌,酪氨酸,剂量依赖,量依赖性,素处理,肾癌细胞,肾细胞癌
AB值:
0.268842
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