为研究野生与养殖小黄鱼群体的遗传多样性,基于mtDNA Cytb基因和D-loop控制区对舟山嵊泗海域(SS)和象山三门口海域(SMK)2个小黄鱼野生群体和1个养殖群体(YZ)的遗传结构与遗传分化等进行比较分析.序列分析结果显示,Cytb基因序列为841 bp,其A+T含量(50.2％)与C+G含量(49.8％)相似;D-loop区序列为629～635 bp,A+T含量(58.9％)远高于C+G含量(41.1％).SS、SMK和YZ群体Cytb基因的单倍型数分别为26、27和12,SS和SMK群体共享2个单倍型(Hap1和Hap13),SMK和YZ群体共享1个单倍型(Hap41);SS、SMK和YZ群体D-loop区的单倍型数分别为27、30和10,SS和SMK群体共享1个单倍型(Hap4).多样性分析结果显示,3个群体均属于高单倍型多样性(Hd>0.5),其中,SS和SMK群体单倍型多样性和核苷酸多样性高于YZ群体,表明野生群体多样性略高于养殖群体.遗传分化指数显示,2个小黄鱼野生群体间的分化程度极小,而养殖群体与野生群体间存在中度分化.遗传分化指数和AMOVA分析结果表明,群体内个体的变异是遗传变异的主要来源.Cytb基因和D-loop区序列中性检验结果中SS和SMK群体的Tajima's D值和Fu and Li's值均为负数,且Cytb基因的Tajima's D值和Fu and Li's值显著(P<0.05)偏离中性,表明2个野生群体有可能经历过群体扩张.单倍型系统发育树显示,SS、SMK和YZ群体均未表现出明显的地理聚集,群体间互有交叉,表明3个群体间的分化尚不明显.

小黄鱼;线粒体DNA;Cytb基因;D-loop区;遗传多样性

郭丹丹;刘峰;牛宝龙;楼宝

浙江省农业科学院 水生生物研究所,浙江 杭州310021

浙江农业学报

[1]郭丹丹;刘峰;牛宝龙;楼宝-.基于线粒体Cytb基因和D-loop区的野生与养殖小黄鱼群体遗传多样性)[J].浙江农业学报,2022(09):1856-1865

SMK,Hap13,Hap41

Cytb,loop,小黄鱼,鱼群,群体遗传,遗传多样性,mtDNA,控制区,舟山,嵊泗,海域,SS,象山,三门,门口,野生群体,养殖群体,YZ,遗传结构,遗传分化,序列分析,基因序列,bp,A+T,C+G,多样性分析,单倍型多样性,Hd,核苷酸多样性,略高于,群体间,分化程度,极小,AMOVA,群体内,遗传变异,中性检验,Tajima,Fu,Li,负数,系统发育树,互有

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