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多队列分析揭示氯化物通道配体4在结肠癌中的表达和预后意义
文献摘要:
目的 与癌旁组织相比,氯化物通道配体4(chloride channel accessory 4,CLCA4)在多瘤种中存在差异表达,但在结肠癌中,其作为临床预后、免疫细胞浸润特征生物标志物的价值仍未被挖掘.方法 本研究在癌症基因图谱队列、GSE32323队列、基因表达谱互作分析数据库和人类蛋白质图谱数据库中比较了肿瘤组织和正常组织中CLCA4的表达丰度.采用Cox回归分析CLCA4表达、临床病理特征与生存的关系;采用基因集富集分析探索CLCA4可能参与的肿瘤生物学行为;采用扩展的多维免疫组学特征算法和CIBERSORT算法评估CLCA4对肿瘤浸润免疫细胞分布的影响.结果 CLCA4在结肠癌中表达下降提示不良预后;CLCA4低表达组和高表达组的肿瘤微环境中的12种免疫细胞成分存在显著差异;CLCA4在APC突变型患者中表达水平较低;CLCA4表达水平与核苷酸切除修复、DNA复制等生物学过程相关.结论 CLCA4参与影响结肠癌微环境中的肿瘤浸润免疫细胞的分布,并可作为预后生物标志物.
文献关键词:
结肠癌;氯化物通道配体4;肿瘤微环境;预后
中图分类号:
作者姓名:
郏科人;陈杨;沈琳;章程
作者机构:
北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所 消化肿瘤内科 恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室,北京 100142
文献出处:
引用格式:
[1]郏科人;陈杨;沈琳;章程-.多队列分析揭示氯化物通道配体4在结肠癌中的表达和预后意义)[J].肿瘤综合治疗电子杂志,2022(02):64-73
A类:
CLCA4,GSE32323
B类:
多队列,氯化物,结肠癌,预后意义,癌旁组织,chloride,channel,accessory,差异表达,临床预后,免疫细胞浸润,癌症基因图谱,基因表达谱,互作分析,类蛋白质,谱数据,中比,肿瘤组织,正常组织,Cox,临床病理特征,基因集富集分析,分析探索,生物学行为,CIBERSORT,肿瘤浸润免疫细胞,不良预后,低表达,肿瘤微环境,细胞成分,APC,突变型,核苷酸切除修复,生物学过程,预后生物标志物
AB值:
0.279787
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