胆管癌是一种起病隐匿、侵袭性强、致死率高的原发性恶性肿瘤.多聚嘧啶区结合蛋白1(polypyrimidine tract-binding protein 1,PTBP1)已被报道,在多种类型肿瘤组织中异常高表达并参与癌症进展,但其在胆管癌中的作用仍未见报道.该研究旨在探讨PTBP1在胆管癌中的生物学功能,并初步解析其分子机制.本文利用公开的癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据,分析了胆管癌及癌旁组织中的PTBP1 mRNA表达水平.结果显示,PTBP1在胆管癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织(P＜0.05).随后,在胆管癌细胞系RBE和HuH28中,通过CCK-8和细胞平板克隆实验,评价了 PTBP1对胆管癌细胞生长能力的影响.结果显示,过表达PTBP1可显著促进胆管癌细胞的生长(P＜0.01),而敲低PTBP1显著抑制胆管癌细胞的生长(P＜0.001)o Transwell和Invasion实验结果显示,过表达PTBP1可显著促进胆管癌细胞的迁移和侵袭(P＜0.001),而敲低PTBP1显著抑制胆管癌细胞的迁移和侵袭(P＜0.001).转录物组测序和通路富集分析结果显示,在胆管癌细胞中,敲低PTBP1后上调表达的基因显著富集于p53信号通路;而下调表达的基因显著富集于胆固醇代谢、Rho GTPase和TGF-β等信号通路.基于上述转录物组测序数据,本文还分析发现,敲低PTBP1可导致一系列基因发生异常的mRNA可变剪接事件,例如参与TGF-β调控的TGIF1及与p53活性相关的GNAS基因等.综上所述,PTBP1可能通过调控一系列基因的可变剪接而影响多个癌症相关的信号通路,从而促进胆管癌的进展.

胆管癌;多聚嘧啶区结合蛋白1;转录物组测序;可变剪接;TGIF1;GNAS

张静;程敏;金倩;曹鹏博;周钢桥

河北大学生命科学学院生物学系,河北,保定071002;军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所,蛋白质组学国家重点实验室,国家蛋白质科学中心(北京),北京100850;南京医科大学公共卫生学院流行病学系,南京211166;徐州医科大学肿瘤生物治疗研究所,江苏,徐州221002

中国生物化学与分子生物学报

[1]张静;程敏;金倩;曹鹏博;周钢桥-.多聚嘧啶区结合蛋白1通过调控基因的可变剪接促进胆管癌细胞的生长、迁移及侵袭能力)[J].中国生物化学与分子生物学报,2022(07):899-910

polypyrimidine,HuH28,转录物组测序

多聚,嘧啶,结合蛋白,调控基因,可变剪接,胆管癌细胞,迁移及侵袭,侵袭能力,起病,隐匿,侵袭性,致死率,性恶,tract,binding,protein,PTBP1,多种类型,肿瘤组织,见报,生物学功能,癌症基因组图谱,cancer,genome,atlas,TCGA,癌旁组织,癌组织,细胞系,RBE,CCK,平板克隆实验,细胞生长,过表达,敲低,Transwell,Invasion,迁移和侵袭,通路富集分析,p53,胆固醇代谢,Rho,GTPase,TGF,序数,TGIF1,活性相,GNAS,综上所述

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