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典型文献
类风湿关节炎与骨质疏松症的生物信息学分析
文献摘要:
目的 利用生物信息学分析类风湿关节炎(RA)与骨质疏松症(OP)的关系.方法 通过Genecards、OMIM、TTD等数据库查找RA和OP的疾病基因,对两组疾病的基因取交集,将共同基因导入STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络图,使用R软件筛选出PPI网络中的关键基因,利用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析.结果 通过检索数据库筛选出RA相关基因5388个、OP相关基因4587个,取交集后获得共同靶点基因1899个,PPI网络图显示IL-6、INS、AKT1、TNF、TP53、VEGFA、EGFR等为RA与OP的共同关键基因,GO富集主要与受体配体活性、细胞因子受体结合、囊泡、T细胞活化、肽分泌的调节等相关,KEGG信号通路包括PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路、破骨细胞分化、细胞凋亡、Th17细胞分化等.结论 所获得RA与OP的共同关键基因和涉及的信号通路,有助于理解两者在疾病过程中的相关性,为药物的研发提供理论参考.
文献关键词:
类风湿关节炎;骨质疏松症;生物信息学;信号通路
作者姓名:
蔡鑫;唐芳;马武开;蒋总;金泽旭;樊梅
作者机构:
贵州中医药大学,贵州 贵阳550002;贵州中医药大学第二附属医院,贵州 贵阳550003
引用格式:
[1]蔡鑫;唐芳;马武开;蒋总;金泽旭;樊梅-.类风湿关节炎与骨质疏松症的生物信息学分析)[J].中国骨质疏松杂志,2022(03):386-391,402
A类:
B类:
类风湿关节炎,骨质疏松症,生物信息学分析,利用生物,RA,OP,Genecards,OMIM,TTD,疾病基因,交集,STRING,数据库构建,蛋白互作,PPI,网络图,关键基因,DAVID,富集分析,靶点基因,INS,AKT1,TP53,VEGFA,EGFR,细胞因子受体,囊泡,细胞活化,PI3K,Akt,JAK,STAT,破骨细胞分化,Th17
AB值:
0.301669
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