典型文献
基于CRISPR-Cas13a和RT-RAA的HIV核酸检测方法的建立
文献摘要：
目的 探索一种基于成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)和反转录重组酶介导的等温扩增(RT-RAA)技术HIV核酸检测新方法的可行性.方法 在HIV网络数据库下载HIV CRF07_BC亚型基因序列,根据保守序列设计RT-RAA引物和crRNA.通过荧光法CRISPR核酸检测筛选crRNA;利用梯度稀释的HIV RNA模板评价荧光法和试纸法CRISPR核酸检测的灵敏度;利用6种病原体核酸和不同亚型的HIV临床样本评价该方法的特异性.结果 从5条候选的crRNA中筛选出了 1条检测灵敏度较高的crRNA;荧光法和试纸法CRISPR核酸检测HIV RNA的灵敏度均为10拷贝/μL,与RT-qPCR法的灵敏度一致.荧光法和试纸法CRISPR核酸检测均可特异性检出HIV CRF07_BC亚型,与其他病原体核酸无明显交叉反应.在20例HIV临床样本检测中,试纸法CRISPR核酸检测准确检出了 10例CRF07_BC以及1例B亚型.结论 本研究建立了针对HIV CRF07_BC亚型的CRISPR核酸检测方法,具有便携、快速、高灵敏度和特异性的特点,为HIV感染者的检测和抗病毒治疗过程监测提供新的方法.
文献关键词：
艾滋病病毒;成簇的规律间隔的短回文重复序列;等温扩增;CRF07_BC亚型;核酸检测
中图分类号：
作者姓名：
李小辉;粟斌;寇志华;吴昊;张彤;孙岩松;韩尧;乔惠丽;李浩;姜太一
作者机构：
南阳师范学院生命科学与农业工程学院,河南南阳473061;首都医科大学附属北京佑安医院感染中心,北京100069;军事医学研究院微生物流行病研究所,北京100071
文献出处：
引用格式：
[1]李小辉;粟斌;寇志华;吴昊;张彤;孙岩松;韩尧;乔惠丽;李浩;姜太一-.基于CRISPR-Cas13a和RT-RAA的HIV核酸检测方法的建立)[J].中国艾滋病性病,2022(03):264-270
A类：
B类：
CRISPR,Cas13a,RAA,HIV,核酸检测方法,成簇的规律间隔的短回文重复序列,重组酶介导的等温扩增,网络数据库,下载,CRF07,BC,基因序列,保守序列,序列设计,引物,crRNA,荧光法,检测筛选,梯度稀释,试纸法,病原体,不同亚型,临床样本,检测灵敏度,拷贝,qPCR,交叉反应,高灵敏度,感染者,抗病毒治疗,治疗过程,过程监测,艾滋病病毒
AB值：
0.255117
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