典型文献
基于Ks分布的被子植物演化的时间尺度研究
文献摘要:
物种演化时间估算是生命演化研究的重要部分.近年来,许多研究发现由于不同基因和不同物种的进化速率差异显著,因此需要新的方法对进化事件发生时间进行重新估计.为了对被子植物演化时间的重新估计,该研究基于共享多倍化事件或共享分歧事件应该有共同同义突变率(Ks)峰值的理念,建立了基于基因组数据的进化速率矫正模型.结果表明:(1)对获取Ks分布三种常见方式进行比较分析,明确了通过提取共线性区块上Ks值的中位数的方式最优.(2)模拟了Ks值随时间累积系数(v)变化过程下的Ks分布,当假设v服从正态分布时,Ks分布出现了长尾现象.(3)将矫正方法应用到被子植物中,发现不同谱系的被子植物具有同步的辐射进化和适应性进化现象.并且,被子植物的进化速率虽然差异显著,但不同分支间的进化速率仍具有部分一致性,如木兰类植物进化速率最慢,真双子叶植物次之,单子叶植物进化速率最快.最终得到了相对可靠的物种同义突变率演化时间轴,为植物研究提供了系统发育和演化的支撑.
文献关键词:
同义突变率(Ks)分布;被子植物;时间矫正;系统发育树;进化速率
中图分类号:
作者姓名:
焦贝贝;王希胤
作者机构:
华北理工大学 生命科学学院,河北 唐山063210
文献出处:
引用格式:
[1]焦贝贝;王希胤-.基于Ks分布的被子植物演化的时间尺度研究)[J].广西植物,2022(10):1684-1693
A类:
时间矫正
B类:
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AB值:
0.283075
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