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花生TCP家族基因鉴定及其在侧枝发育中的表达分析
文献摘要：
TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating cell factors)转录因子作为植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育的多个重要进程.本研究利用生物信息学方法对花生TCP基因家族成员进行鉴定,结合花生侧枝转录组数据进行表达分析.结果表明:在四倍体花生AABB、二倍体AA和BB基因组中分别鉴定获得30个AhTCPs、11个AduTCPs和10个AipTCPs,定位到14、6和5条染色体上;与拟南芥AtTCPs蛋白聚类分析发现,花生TCP蛋白可分为ClassⅠ和ClassⅡ(CYC/TB1和CIN)2个亚类;AhTCPs基因中含有1～6个数量不等的外显子和5个不同的motif;蛋白质长度为131～658个氨基酸,分子量为9.94～72.66 kD;大部分成员定位在细胞核上;家族基因启动子顺式作用元件分析发现,在AA、BB、AABB基因组分别获得77、75和94种顺式作用元件.转录组结果分析表明,24个AhTCPs在侧枝发育过程中存在不同程度的表达,大多数AhTCPs基因在2个品种('冀花5号'和'M130')6个时期中高表达.以上结果为进一步了解花生TCP家族的生物学功能提供理论基础.
文献关键词：
花生;TCP转录因子家族;生物信息学分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
张靖男;韦丽君;陈娟娟;杨鑫雷;穆国俊;侯名语;崔顺立;刘立峰
作者机构：
河北农业大学 华北作物改良与调控国家重点实验室/华北作物种质资源教育部重点实验室/河北省种质资源实验室,河北 保定 071001
文献出处：
引用格式：
[1]张靖男;韦丽君;陈娟娟;杨鑫雷;穆国俊;侯名语;崔顺立;刘立峰-.花生TCP家族基因鉴定及其在侧枝发育中的表达分析)[J].河北农业大学学报,2022(03):25-33
A类：
Teosinte,Cycloidea,AhTCPs,AduTCPs,AipTCPs,AtTCPs
B类：
花生,家族基因,基因鉴定,侧枝发育,表达分析,branched,Proliferating,cell,factors,植物生长发育,研究利用,利用生物,生物信息学方法,基因家族,转录组数据,四倍体,AABB,二倍体,拟南芥,Class,CYC,TB1,CIN,亚类,外显子,motif,分子量,kD,细胞核,基因启动子,顺式作用元件,M130,生物学功能,生物信息学分析
AB值：
0.300736
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