典型文献
基于网络药理学与分子对接探讨"黄芪-当归"治疗年龄相关性黄斑变性的作用机制
文献摘要:
目的:通过网络药理学和分子对接方法探讨中药"黄芪-当归"治疗年龄相关性黄斑变性(AMD)的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取中药黄芪、当归的有效成分与作用靶点,使用Uniport数据库进行基因ID的注释,在GeneCards、OMIM数据库中查找AMD的相关基因.使用Cytoscape 3.7.2将药物-关键有效成分-疾病靶点网络可视化,在String数据库平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,再利用Metascape基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用AutoDock4.2.6软件对关键靶点蛋白及有效成分进行分子对接验证.结果:通过筛选,得到黄芪-当归有效成分22个,与AMD相关的关键有效成分14个,黄芪-当归与AMD的共同基因靶点52个;PPI中核心基因依次为CASP3、IL6、VEGFA、EGFR、ESR1等;GO功能富集得到1064个条目,生物学过程主要涉及细胞凋亡、对类固醇激素的反应、活性氧代谢、对脂多糖的反应等;KE GG富集分析后得到119条信号通路,与癌症的通路、流体剪切力与动脉粥样硬化、HIF-1信号通路、TNF信号通路、VEGF信号通路等机制相关;分子对接结果表明,核心有效成分可与靶点蛋白形成构象能量较低、结构稳定的对接.结论:"黄芪-当归"治疗AMD具有多成分、多靶点、多通路的特点,为进一步研究AMD的治疗提供了思路.
文献关键词:
黄芪;当归;年龄相关性黄斑变性;机制;网络药理学;分子对接
中图分类号:
作者姓名:
孟欢;刘自强;韩梦雨;农璐琪;金明
作者机构:
北京中医药大学,北京,100029;中日友好医院,北京,100029
文献出处:
引用格式:
[1]孟欢;刘自强;韩梦雨;农璐琪;金明-.基于网络药理学与分子对接探讨"黄芪-当归"治疗年龄相关性黄斑变性的作用机制)[J].世界中医药,2022(07):941-946
A类:
B类:
网络药理学与分子对接,黄芪,当归,年龄相关性黄斑变性,对接方法,AMD,系统药理学,分析平台,TCMSP,有效成分,作用靶点,Uniport,ID,GeneCards,OMIM,Cytoscape,靶点网络,网络可视化,String,平台构建,蛋白质相互作用,PPI,Metascape,基因本体,京都基因和基因组百科全书,通路富集分析,AutoDock4,关键靶点,靶点蛋白,白及,过筛,基因靶点,核心基因,CASP3,IL6,VEGFA,EGFR,ESR1,功能富集,条目,生物学过程,类固醇激素,活性氧代谢,脂多糖,流体剪切力,动脉粥样硬化,HIF,构象,结构稳定,多成分,多靶点,多通路
AB值:
0.313024
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。