典型文献
基于GEO数据挖掘分析肝硬化-肝癌的演变机制
文献摘要：
目的:应用生物信息学方法挖掘肝硬化-肝癌演变的关键基因,并探究其机制.方法:使用GEO2R,从数据集GSE6764中筛选出在肝硬化组织和极早期肝癌组织中差异表达的基因,随后进行GO和KEGG分析;构建蛋白质-蛋白质相互作用网络后通过Cytoscape软件中的MCODE插件检测网络中最显著模块所含关键基因;对关键基因进行聚类分析和预后分析.结果:共筛选出169个差异表达基因,其中表达上调和下调的基因数目分别为19个和150个.MCODE筛选后获得16个关键基因,主要与细胞因子和免疫等因素相关,其中关键基因MPEG1与肝癌患者无病生存期相关.结论:本研究发现的关键基因,有助于认识肝硬化-肝癌的演变机制,并可作为早期肝癌防治的潜在标志物.
文献关键词：
肝硬化;肝癌;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
陈燕;刘军;莫之婧
作者机构：
桂林医学院广西高校生物化学与分子生物学重点实验室,广西 桂林 541199;桂林优利特医疗电子有限公司, 广西 桂林 541004
文献出处：
引用格式：
[1]陈燕;刘军;莫之婧-.基于GEO数据挖掘分析肝硬化-肝癌的演变机制)[J].华夏医学,2022(06):1-5
A类：
GSE6764,MPEG1
B类：
挖掘分析,肝硬化,演变机制,生物信息学方法,关键基因,GEO2R,极早,早期肝癌,肝癌组织,蛋白质相互作用网络,Cytoscape,MCODE,插件,测网,所含,预后分析,差异表达基因,肝癌患者,无病生存期,肝癌防治,潜在标志物
AB值：
0.285449
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
