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花生紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定及表达分析
文献摘要：
紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatase,PAP)是一类金属磷酸酯酶,参与植物的磷素利用、碳代谢、细胞壁合成等多种生理功能,尤其是对磷缺乏的适应.本研究利用生物信息学手段在花生(Arachis hypogaea L.)全基因组水平上对PAP基因家族进行了鉴定,并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构以及它们在22个组织中的表达模式进行了分析.结果表明:花生基因组中有39个AhPAP基因,氨基酸序列长度为205～905,等电点大多数都小于7,蛋白质C端均含有金属磷酸酶结构域.以花生、拟南芥、水稻、苜蓿共74个PAP蛋白构建的系统发育树可分为四组,每组中都含有来自不同物种的PAP,并没有因为物种差异而各自聚为一类.AhPAP基因家族中部分成员的表达具有组织特异性,arahy.P03NME、arahy.DAPS6C在根瘤中表达量最高,而它们在其他组织中表达量较低或未检测到表达.本研究为揭示AhPAP基因家族在花生中的生物学功能奠定了基础.
文献关键词：
花生;紫色酸性磷酸酶;生物信息学;基因家族
中图分类号：
作者姓名：
杜普旋;刘浩;胡冬秀;陈小平;洪彦彬;李友国
作者机构：
华中农业大学,农业微生物学国家重点实验室,湖北武汉,430070;广东省农业科学院作物研究所,国家油料作物改良中心南方分中心,广东省农作物遗传改良重点实验室,广东广州, 510640
文献出处：
引用格式：
[1]杜普旋;刘浩;胡冬秀;陈小平;洪彦彬;李友国-.花生紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定及表达分析)[J].中国油料作物学报,2022(03):522-531
A类：
紫色酸性磷酸酶,AhPAP,P03NME,DAPS6C
B类：
花生,酶基因,基因家族,表达分析,purple,acid,phosphatase,类金属,磷酸酯,酯酶,磷素利用,碳代谢,细胞壁,生理功能,研究利用,利用生物,Arachis,hypogaea,全基因组,系统进化,进化关系,保守结构域,基因结构,表达模式,氨基酸序列,等电点,酶结构,拟南芥,水稻,苜蓿,系统发育树,四组,物种差异,自聚,有组织,组织特异性,arahy,根瘤,他组织,组织中表达,未检,生物学功能
AB值：
0.366367
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