典型文献
芥菜种子颜色调控基因TT8的等位变异及其地理分布分析
文献摘要：
在芸薹属植物中TT8基因是种子颜色的调控基因.异源四倍体芥菜TT8基因有2个拷贝,分别位于A09与B08染色体上.本研究针对不同拷贝设计特异引物,对749份芥菜进行扩增、测序或酶切检测,发现BjuA09.TT8和BjuB08.TT8各有7个和6个等位变异.与野生型相比,BjuA09.TT8.a1-a5和BjuB08.TT8.b1-b4等位基因都发生了大片段插入,而BjuA09.TT8.a6出现了删除,但BjuB08.TT8.b5仅在第7外显子处有1个碱基替换.使用Repeatmasker软件对等位基因序列与甘蓝型油菜注释库进行重复序列比对,发现BjuA09.TT8.a1-a4和BjuB08.TT8.b1-b4等位基因主要含有I类转座子,少量为II类转座子及Helitron类转座子插入.统计还发现,BjuA09.TT8.a4-BjuB08.TT8.b5单倍型为主要的黄籽单倍型,占所分析黄籽材料的89.49％(247/276),其次为BjuA09.TT8.a4-BjuB08.TT8.b3单倍型,占6.52％.地理分布分析结果显示,中国尤其是新疆芥菜黄籽突变等位基因频率显著高于世界其他地区,这与历史记载相印证,说明芥菜黄籽性状可能起源于中国新疆.本研究结果为油菜黄籽育种选用优异基因资源提供了依据.
文献关键词：
芥菜;黄籽;TT8;等位变异;转座子;种质资源;地理分布
中图分类号：
作者姓名：
张钰坤;陆赢;崔看;夏石头;刘忠松
作者机构：
湖南农业大学农学院 / 作物基因工程湖南省重点实验室, 湖南长沙 410128;国家油料作物改良中心湖南分中心, 湖南长沙 410128;湖南农业大学生物科学技术学院, 湖南长沙 410128
文献出处：
引用格式：
[1]张钰坤;陆赢;崔看;夏石头;刘忠松-.芥菜种子颜色调控基因TT8的等位变异及其地理分布分析)[J].作物学报,2022(06):1325-1332
A类：
BjuA09,BjuB08,Repeatmasker,Helitron
B类：
芥菜,菜种,颜色调控,调控基因,TT8,等位变异,地理分布分析,芸薹属,异源四倍体,拷贝,特异引物,野生型,a1,a5,b1,b4,大片,a6,删除,b5,外显子,碱基,基因序列,甘蓝型油菜,重复序列,序列比对,a4,转座子,II,单倍型,黄籽,所分,b3,等位基因频率,历史记载,中国新疆,育种,异基因,基因资源,资源提供,种质资源
AB值：
0.24413
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