目的·分析WD40重复蛋白43(WD 40 repeat protein 43,WDR43)mRNA在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)细胞中的表达及其与LUAD患者预后的相关性,并探讨WDR43对LUAD细胞发生紫杉醇耐药的影响.方法·通过癌症治疗反应门户网站(Cancer Therapeutics Response Portal,CTRP),下载LUAD细胞的紫杉醇敏感性与其基因表达的相关性系数,筛选紫杉醇耐药相关基因,行基因本体数据库(Gene Ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)通路分析,并以相关基因WDR43作为研究对象行后续分析及验证.检索人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)数据库,分析WDR43蛋白在LUAD组织中的表达和定位.检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,分析WDR43 mRNA在LUAD组织和正常肺组织中的表达差异、LUAD患者的WDR43突变情况以及WDR43 mRNA与不同临床病理因素的相关性.检索CaArray数据库,分析WDR43 mRNA与LUAD患者预后之间的相关性.检索肿瘤浸润性免疫细胞分析(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库,分析WDR43表达与LUAD组织中免疫细胞浸润水平的相关性.通过癌症细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)数据库比较不同LUAD细胞中WDR43基因表达,构建差异表达WDR43的LUAD细胞,并采用MTT实验和平板克隆形成实验验证WDR43表达对紫杉醇耐药性的影响.结果·通过CTRP筛选出了LUAD细胞紫杉醇敏感性相关基因WDR43.GO功能分析和KEGG通路分析的结果显示,WDR43等基因与rRNA合成、细胞形态调控等相关,且主要富集在单纯疱疹病毒1感染信号通路和胞浆DNA感受器信号通路.HPA数据库的分析结果显示,WDR43蛋白主要表达于LUAD细胞的细胞核、细胞质及细胞膜中.TCGA数据库的分析结果显示,WDR43 mRNA在LUAD组织中的表达明显高于正常肺组织(P=0.000),在LUAD吸烟患者的癌组织中的表达明显高于非吸烟者(P=0.000),在TP53突变型患者中的表达亦高于TP53野生型患者(P=0.000).CaArray数据库的分析结果显示,WDR43 mRNA高表达的LUAD患者的预后较差(均P=0.000).TIMER数据库的分析结果显示,WDR43表达可促进LUAD组织中的中性粒细胞、CD8+T细胞、骨髓来源的抑制性细胞、巨噬细胞的浸润,抑制CD4+T细胞的浸润.体外实验证实,过表达WDR43可增强LUAD细胞对紫杉醇的耐药能力.结论·WDR43在LUAD组织中的表达显著增加且与患者预后呈负相关,WDR43的过表达可增强LUAD细胞的紫杉醇耐药能力.

WD40重复蛋白43;肺腺癌;紫杉醇;化疗耐药;预后

赵雪;董春燕

同济大学医学院,上海 200092;上海市普陀区长寿街道社区卫生服务中心,上海 200060;同济大学附属东方医院肿瘤科,上海 200120

上海交通大学学报（医学版）

[1]赵雪;董春燕-.WD40重复蛋白43在肺腺癌中的表达及其对细胞紫杉醇耐药的影响)[J].上海交通大学学报（医学版）,2022(12):1656-1665

WDR43,CaArray

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