为探究鳗弧菌和迟钝爱德华氏菌对短蛸肝脏菌群结构的影响,从烟台附近海域采集短蛸样品,取对照组、注射迟钝爱德华氏菌组、注射鳗弧菌组短蛸的肝脏组织,提取DNA后进行16 S rRNA基因扩增子测序,基于生物信息学方法分析与比较样品间的菌群结构,并利用PICRUSt软件对菌群的功能进行预测.3组样品测序后共获得217287条有效序列,迟钝爱德华氏菌组与对照组共有的运算分类单元(OTU)为373个,鳗弧菌组与对照组共有的运算分类单元为166个;Alpha指数显示,对照组肝脏的微生物群落多样性最高,鳗弧菌组最低;门水平上,对照组中的优势菌群是变形菌门(46.2％)、拟杆菌门(13.32％)等,迟钝爱德华氏菌组的核心菌门为变形菌门(43.33％)、软壁菌门(31.33％)等,而鳗弧菌组核心菌门软壁菌门比例高达95.95％;属水平上,对照组的核心菌属由支原体属(9.01％)、短波单胞菌属(5.74％)、Gp4(5.16％)等构成,迟钝爱德华氏菌组丰度最高的4个属依次为支原体属(31.28％)、乳球菌属(9.49％)、肠杆菌属(6.07％)和单胞菌属(3.71％),鳗弧菌组丰度最高的为支原体属(95.94％);聚类热图显示,对照组与迟钝爱德华氏菌组聚为一支,鳗弧菌组单独聚为一支,对照组与迟钝爱德华氏菌组菌群分布较类似;PICRUSt预测结果显示,短蛸肝脏菌群主要功能与新陈代谢类功能有关,注射病菌后,代谢类和细胞通路类功能丰度变低.试验结果显示:短蛸肝脏具有稳定的菌群结构,维持短蛸正常的免疫和代谢活动;注射病菌后肝脏菌群的多样性与丰度发生变化,其中鳗弧菌组变化较大,表明鳗弧菌对短蛸肝脏菌群产生了较大影响.试验结果可为短蛸养殖过程中细菌性疾病的准确诊断与防控提供基础资料.

短蛸;肝脏菌群;16S rRNA基因扩增子测序;鳗弧菌;迟钝爱德华氏菌

上海海洋大学,水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306;山东省海洋生态资源重点修复实验室,山东省海洋资源与环境研究院,山东 烟台 264006;上海海洋大学,上海水产养殖工程技术研究中心,上海 201306;长岛综合试验区海洋经济促进中心,山东 烟台 265800;鲁东大学 农学院,山东 烟台 264025

[1]朱兴华;王金龙;袁廷柱;冯艳微;李赞;徐晓辉;王卫军;孙国华;杨建敏-.鳗弧菌和迟钝爱德华氏菌对短蛸肝脏菌群结构的影响)[J].水产科学,2022(06):976-984

肝脏菌群

鳗弧菌,迟钝爱德华氏菌,短蛸,菌群结构,烟台,近海,海域,肝脏组织,rRNA,基因扩增,扩增子测序,生物信息学方法,分析与比较,PICRUSt,共获,OTU,Alpha,微生物群落多样性,优势菌群,变形菌门,拟杆菌门,核心菌,支原体,短波,单胞菌,Gp4,肠杆菌属,热图,菌群分布,群主,主要功能,新陈代谢,细胞通路,变低,代谢活动,多样性与丰度,细菌性疾病,诊断与防控,基础资料,16S

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