典型文献
基于高通量测序的野生和养殖台湾白甲鱼皮肤细菌群落多样性分析
文献摘要：
为探究野生和养殖台湾白甲鱼Onychostoma barbatulum Pellegrin皮肤细菌菌群组成及其多样性,采用16S rRNA基因V3～V4 区高通量测序法,对1龄野生及养殖的健康台湾白甲鱼皮肤细菌进行测序及信息学分析.结果表明:台湾白甲鱼皮肤细菌菌群主要分布在 18 个门,其中,变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes和放线菌门Actinobacteria的菌落数最多;从属水平分析,菌落含量丰富度排名前 8 的菌主要分布在嗜氢菌属Hydrogenophilus、变形杆菌属Proteus、芽孢杆菌属Bacillus、水栖菌属Enhydrobacter、普雷沃菌属Prevotella、刺骨鱼菌属Epulopiscium、纤维弧菌属Cellvibrio和雷尔氏菌属Ralsto-nia;细菌群落功能分析显示,这些菌群主要参与氨基酸代谢、碳水化合物代谢、辅因子与维生素代谢、脂代谢、次级代谢产物合成和能量代谢;通过比较野生和养殖台湾白甲鱼皮肤细菌群落发现,厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、疣微菌门和酸杆菌门是台湾白甲鱼中广泛存在的菌群.研究表明,野生和养殖台湾白甲鱼皮肤的细菌群落组成及多样性存在明显差异,野生台湾白甲鱼皮肤的细菌菌群远多于养殖台湾白甲鱼.
文献关键词：
台湾白甲鱼;皮肤细菌;高通量测序;细菌群落组成
中图分类号：
作者姓名：
许竟成;林衍峰;杨泉;沈冰1燕;耿洪璐;李梅;李婷婷;杨奥伟;柏晓辉
作者机构：
黄山学院 生命与环境科学学院, 安徽 黄山 245041;休宁县水产站, 安徽 休宁 245400
文献出处：
引用格式：
[1]许竟成;林衍峰;杨泉;沈冰1燕;耿洪璐;李梅;李婷婷;杨奥伟;柏晓辉-.基于高通量测序的野生和养殖台湾白甲鱼皮肤细菌群落多样性分析)[J].大连海洋大学学报,2022(06):913-921
A类：
台湾白甲鱼,barbatulum,Pellegrin,Hydrogenophilus,Enhydrobacter,Epulopiscium,Ralsto
B类：
鱼皮,皮肤细菌,细菌群落多样性,多样性分析,Onychostoma,细菌菌群,菌群组成,16S,rRNA,V3,V4,高通量测序法,群主,变形菌门,Proteobacteria,厚壁菌门,Firmicutes,拟杆菌门,Bacteroidetes,放线菌,Actinobacteria,菌落数,数最多,从属,水平分析,丰富度,变形杆菌,Proteus,芽孢杆菌属,Bacillus,水栖,普雷沃菌属,Prevotella,刺骨,弧菌,Cellvibrio,nia,细菌群落功能,功能分析,氨基酸代谢,碳水化合物代谢,辅因子,脂代谢,次级代谢产物,产物合成,能量代谢,落发,酸杆菌,细菌群落组成
AB值：
0.270279
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