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典型文献
基于网络药理学探讨丹参对急性心肌梗死靶基因的作用及抗炎机制
文献摘要:
目的 采用网络药理学探讨丹参对急性心肌梗死(AMI)患者靶基因白脂素(Asprosin)和脂肪因子(Metrnl)水平的影响及其抗炎机制.方法 通过TCMSP、Genecard、OMIM数据库获得丹参和AMI的核心靶点,利用R语言绘制韦恩图,利用Cytoscape 3.7.2、STRING、DAVID和Kabas 3.0等分析软件获得相关通路数据.同时,收集2019年1月—2020年1月南平市第一医院收治的30例AMI患者作为AMI组,另选取本院同期30例体检健康人群作为健康对照组.采用Western Blotting法检测患者Metrnl、Asprosin蛋白水平表达;并测定受试者白介素(IL)-6和超敏C反应蛋白(hs-CRP);采用Pearson相关分析AMI患者炎性因子与Metrnl、Asprosin的关系.结果 应用TCMSP数据库获得丹参69个化合物,最终获得丹参有效化学成分65个.通过Genecard和OMIM数据库检索AMI靶点,筛选出580个AMI靶点,通过Venny 2.1软件获取AMI与丹参的交集靶点有29个.通过STRING 10.5软件针对AMI与丹参的交集靶点蛋白质绘制蛋白—蛋白的网络图(置信度>0.4),孤立蛋白隐藏后获得28个节点和107条网络线(平均节点值为7.38),可见靶基因Asprosin、Metrnl的靶点均>7.38,故其可作为蛋白链接网络的枢纽靶点在AMI中发挥关键作用.应用DAVID软件对丹参与AMI的交集靶点基因进行分析,绘制出GO功能富集图.应用Kabas 3.0软件将交集靶点制作成富集通路图,将所得的通路富集结果经过R语言绘制成最终的气泡图(P<0.01作为显示结果),KEGG靶点富集分析图提示G蛋白-cAMP-PKA路径是丹参与AMI最关键的信号通路,此途径与最关键的靶基因Asprosin、Metrnl有一定关系.治疗前,AMI组血清Metrnl、Asprosin表达水平低于健康对照组(P<0.05);治疗后,AMI组血清Metrnl、Asprosin表达水平高于治疗前(P<0.05),且与健康对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05).治疗前,AMI组血清hs-CRP、IL-6水平较健康对照组高(P<0.05);治疗后,AMI组血清hs-CRP、IL-6水平较治疗前低(P<0.05),且与健康对照组比较差异无统计学意义(P>0.05).Pearson相关分析结果显示,AMI患者血清Metrnl、Asprosin表达水平与血清IL-6、hs-CRP水平均分别呈负相关(P<0.05).结论 基于网络药理学分析得到丹参与AMI的共同靶点有29个、关键信号通路20条,并通过实验验证丹参可能通过关键靶基因Metrnl、Asprosin减轻AMI患者的炎性反应,其病理过程可能与激活G蛋白-cAMP-PKA信号通路有关.
文献关键词:
急性心肌梗死;网络药理学;白脂素;脂肪因子
作者姓名:
叶汶;郑远海
作者机构:
353000 福建省南平市第一医院重症医学科
文献出处:
引用格式:
[1]叶汶;郑远海-.基于网络药理学探讨丹参对急性心肌梗死靶基因的作用及抗炎机制)[J].临床合理用药,2022(33):162-165
A类:
Kabas
B类:
网络药理学,丹参,急性心肌梗死,抗炎机制,AMI,白脂素,Asprosin,脂肪因子,Metrnl,TCMSP,Genecard,OMIM,核心靶点,韦恩图,Cytoscape,STRING,DAVID,相关通路,路数,南平市,另选,本院,健康人群,Blotting,蛋白水平表达,白介素,超敏,hs,炎性因子,个化,有效化学成分,数据库检索,Venny,交集靶点,靶点蛋白,网络图,置信度,网络线,靶点基因,功能富集,富集通路,路图,通路富集,集结,气泡图,富集分析,析图,cAMP,PKA,平均分,药理学分析,过关,关键靶基因,炎性反应,病理过程
AB值:
0.239146
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