典型文献
侵染大豆的花生斑驳病毒公主岭分离物基因组测序及分析
文献摘要:
本研究利用小RNA深度测序法在大豆叶片上检测到1株花生斑驳病毒Peanut mottle virus (PeMoV),根据小RNA深度测序结果和GenBank公布的PeMoV基因组序列设计引物克隆了PeMoV公主岭分离物(PeMoV-Gongzhuling)的基因组序列.测序结果经拼接后获得了PeMoV-Gongzhuling基因组,大小为9709个核苷酸(Gen-Bank登录号:MT790744).该基因组在第123位—第9422位存在1个大的开放阅读框(ORF),编码1个多聚蛋白(分子量351.28 kD).PeMoV-Gongzhuling与GenBank中已登录的其他PeMoV分离物的基因组的核苷酸序列一致性为95.88%~99.53%,氨基酸序列一致性为97.39%~99.84%,其中与韩国分离物GYBU-92 (MT603819)在核苷酸和氨基酸水平上的一致性均为最高.
文献关键词:
花生斑驳病毒;基因组;大豆
中图分类号:
作者姓名:
张春雨;李小宇;王晨;战笑蕾;刘建青;王永志
作者机构:
吉林省农业科学院,公主岭136100;吉林农业大学,长春130118;长春师范大学,长春130032
文献出处:
引用格式:
[1]张春雨;李小宇;王晨;战笑蕾;刘建青;王永志-.侵染大豆的花生斑驳病毒公主岭分离物基因组测序及分析)[J].植物保护,2022(01):61-65
A类:
花生斑驳病毒,PeMoV,Gongzhuling,MT790744,GYBU,MT603819
B类:
侵染,公主岭,分离物,基因组测序,研究利用,深度测序,大豆叶片,Peanut,mottle,virus,GenBank,基因组序列,序列设计,引物,拼接,登录号,开放阅读框,ORF,多聚,分子量,kD,序列一致性,氨基酸序列,国分
AB值:
0.237642
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